270037 UE Übungen zu Computergrafik und Molekulare Modellierung (2019W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Besuch der VO Computergrafik und Molekulare Modellierung (270073) dringendst empfohlen!
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von So 01.09.2019 08:00 bis Mi 25.09.2019 23:59
- Abmeldung bis Mi 25.09.2019 23:59
Details
max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
geblockt Dez. / Jän.
Dienstag
26.11.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag
28.11.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Dienstag
03.12.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag
05.12.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Dienstag
10.12.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag
12.12.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Dienstag
17.12.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Dienstag
07.01.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag
09.01.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Dienstag
14.01.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag
16.01.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Dienstag
21.01.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag
23.01.
14:00 - 17:30
Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Beurteilung: Beobachtung der Mitarbeit sowie Beurteilung des abzugebenden Protokolls
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Die Studenten können selbständig Molekülgrafikprogramme verwenden um Informationen über ein bestimmtes Protein zu visualisieren bzw. Unterschiede zwischen verwandten Proteinstrukturen zu
erforschen. Es werden Grundkonzepte von Molekularmechanikrechnungen vermittelt, die zur Ergänzung der strukturbasierten Methoden verwendet
werden.
erforschen. Es werden Grundkonzepte von Molekularmechanikrechnungen vermittelt, die zur Ergänzung der strukturbasierten Methoden verwendet
werden.
Prüfungsstoff
Praktisches Arbeiten am Computer
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
TC-3, M205, M206, CHE II-6, CHE II-7
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:21
Einführung in die Verwendung von Molekülgrafikprogrammen, dzt. primaer VMD. Vergleich von NMR und X-Ray Struktur desselben Biomoleküls.
Quantifizierung von Unterschieden (RMSD, Secondary Structure Assignment, Netzwerk von Wasserstoffbrücken...). Einführung in die weiterführenden Funktionen von VMD. Erzeugen "schöner" Darstellungen und Movies. Kurze Einführung in Molekularmechanikrechnungen (CHARMM). Ein Schwerpunkt dabei liegt im korrekten Aufsetzen
des Systems (Ergaenzen fehlender Koordinaten, Protonierungszustand von Seitenketten des Proteins bzw. des Liganden).Lernbehelfe: Schriftliche Unterlagen werden zur Verfügung gestellt (zum Grossteil in Englisch!)