300094 UE Proteomics in Systems Biology (2024S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

VOR-ORT

Eine Teilnahme an dieser Lehrveranstaltung ist erst nach Absolvierung einer Online-Sicherheitsunterweisung (diverse Module) möglich. Die Prüfung kann ab dem Tag nach einer erfolgreichen Anmeldung und Freischaltung zur Lehrveranstaltung in Moodle absolviert werden. Näheres erfahren Sie unter https://laborlehre-ubb.univie.ac.at/
Alle Übungsräume dürfen ausschließlich mit Labormantel und geschlossenen Schuhen betreten werden, ebenso muss bei Bedarf eine Laborbrille angeschafft werden. Privatsachen bitte in den Garderoberäumen verstauen.

Participation in this course is only possible after completing an online safety instruction (various modules). The exam can be taken from the day after successful registration and activation of the course in Moodle. You can find out more at https://laborlehre-ubb.univie.ac.at/
All practice rooms may only be entered with a lab coat and closed shoes, also lab glasses must, if needed, be purchased. Please store private belongings in the cloakroom.

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Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Do 08.02.2024 14:00 bis Do 22.02.2024 18:00
Abmeldung bis Fr 15.03.2024 18:00

Details

max. 12 Teilnehmer*innen

Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

The course will be from March 11. - 22.
Preliminary meeting via zoom, March 1. at 2 pm. A link will be send out the day before. It is mandatory to attend (!) - notify Prof. Wienkoop if you cannot make it. ideally send a colleague in case you are prevented.
Students on waiting list may also attend as there might be spare space.

    
    Montag
    11.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Mittwoch
    13.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.7 Physiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.041, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Donnerstag
    14.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.7 Physiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.041, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Freitag
    15.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.7 Physiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.041, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Montag
    18.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.4 Mikroskopie 4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.048, Ebene 1
    
    Dienstag
    19.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.4 Mikroskopie 4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.048, Ebene 1
    
    Mittwoch
    20.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.4 Mikroskopie 4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.048, Ebene 1
    
    Donnerstag
    21.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.4 Mikroskopie 4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.048, Ebene 1
    
    Freitag
    22.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.4 Mikroskopie 4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.048, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Begriffe "Proteomics" und "Metabolomics" haben sich in den letzten Jahren gepraegt und sind inzwischen zu einem festen Bestandteil der modernen Biologie geworden. Analog zum Genom (Gesamtheit aller Erbinformation), Metabolom (Gesamtheit aller Metabolite) stellt das Proteom die Gesamtheit aller aktiven Proteine einer Zelle oder eines Gewebes -also der Proteine/Enzyme aus den verschiedenen Stoffwechselwegen - einer Zelle oder eines Gewebes dar. Die Diversität und Dynamik der Proteine eines Organsimus stellt hohe Anforderungen an bioanalytische Technologien, insbesondere die Massenspektrometrie. Im Rahmen dieses Projektpraktikums sollen Grundbegriffe der Technologie Proteomics vermittelt werden und eine spezielle Technik der massenspektrometrischen Analyse und Datenauswertung ("shotgun proteomics" Identifizierung und Quantifizierung) von Proteinen durchgefuehrt werden. Gleichzeitig werden Grundkenntnisse fuer die Massenspektrometrie in der modernen Biologie vermittelt.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

mündliche Diskussion, Questionnair (30%), Laborarbeit (20%), schriftl. Gruppenprotokoll (25%), Gruppen-Abschlussvortrag (25%).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

englisch

Prüfungsstoff

Proteinextraktion, Proteinverdau, Peptidauftrennung HPLC und SDS-PAGE, Massenspektrometrie (Protein identifikation und relative Quantifikation), , Datenanalyse und Interpretation, Datenpresentation

Literatur

Literature will be uploaded to moodel!

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BBO 9, BOE 12, MBO 7, MEC-9, MES5

Letzte Änderung: Di 16.04.2024 14:46