053522 VU Bioinformatik für Phylogenie und evolutionäre Stammbaumrekonstruktion (2019W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Sa 07.09.2019 09:00 bis Mo 23.09.2019 09:00
- Abmeldung bis Mo 14.10.2019 23:59
Details
max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
VB: DO 03.10.2019 10.00-12.00; DO wtl von 03.10.2019 bis 30.01.2020 10.00-12.00 Ort: Seminarraum Strukturchemie, Ebene 1, Campus Vienna Biocenter 5 (VBC5), 1030 Wien
- Donnerstag 03.10. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 10.10. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 17.10. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 24.10. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 31.10. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 07.11. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 14.11. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 21.11. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 28.11. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 05.12. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 12.12. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 09.01. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 16.01. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 23.01. 10:00 - 12:00 extern
- Donnerstag 30.01. 10:00 - 12:00 extern
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Die Beurteilung dieser prüfungsimmanenten Veranstaltung setzt sich aus den folgenden Leistungsnachweisen zusammen:
Zu den Vorlesungen sind gelöste Übungsaufgaben abzugeben. Für die Übungsaufgaben werden Punkte vergeben. Zum Bestehen der Veranstaltung sind 50% der erreichbaren Punkte nötig. Aus der erreichten Gesamtpunktzahl wird die Note ermittelt.
Zu den Vorlesungen sind gelöste Übungsaufgaben abzugeben. Für die Übungsaufgaben werden Punkte vergeben. Zum Bestehen der Veranstaltung sind 50% der erreichbaren Punkte nötig. Aus der erreichten Gesamtpunktzahl wird die Note ermittelt.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.
Prüfungsstoff
Relevant sind alle in der Lehrveranstaltung und den Übungen vorkommenden und behandelten Inhalte.
Literatur
wird in der Lehrveranstaltung bekannt gegeben
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
Module: BIOINF06
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:20
Es werden Themen behandelt wie: historischer Hintergrund; theoretische Grundlagen und Definitionen; verschiedene Ansätze wie Maximum Parsimony, Distanz Methoden, Maximum Likelihood und Bayes'sche Statistik und deren assoziierte Algorithmen; Tree Search und Tree Rearrangements; Modele der Sequenzevolution und Modelselection; Summarizing trees und Branch-Support; Tree Topology Testen; Phylogenetic Signal und Rauschen; Phylogenomik, Supertrees und Partition-Models.
Zu guter letzt finden zwei hands-on Einheiten statt in denen phylogenetische Software am Computer angewandt wird.