300048 UE Sequencing bioinformatics for beginners (2026S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Labels
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 12.02.2026 14:00 bis Do 26.02.2026 18:00
- Abmeldung bis So 15.03.2026 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
- Donnerstag 05.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 19.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 26.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 16.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 23.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 30.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 07.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- N Donnerstag 21.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 28.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 11.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 18.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 25.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Aktive Mitarbeit. Lösen von 4 Aufgaben im Kurs (unter Anleitung).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Einreichen der Lösungsvorschläge für 4 Aufgaben durch Moodle. Bewertet wird zuerst das grundlegende Verständnis der Lösungsansätze, dann die Richtigkeit der Lösung. Jede Aufgabe repräsentiert 25% der Note.
Prüfungsstoff
Application of bash commands introduced in the course; application of mapping, genotyping & filtering tools.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
BAN 5
Letzte Änderung: Fr 20.02.2026 11:48
Wie benutzt man die Command line? Wie arbeitet man mit bash und integrierten Programmen, und nutzt R zu Analyse und Visualisierung? Wie arbeitet man mit großen Dateien, insbesondere durch DNA-Sequenzierung? Welche Dateitypen gibt es in diesem Zusammenhang? Wie benutzt man Referenzgenome, wie werden Sequenzierdaten gemappt und gefiltert? Wie kommt man zu Genotypen, wie prozessiert man diese?