300058 SE Bioinformatics for metagenomics and metatranscriptomics (2012W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Vorbesprechung am 10.1.2013 - 16 Uhr im Besprechungsraum Ökologie, UZA I, Raum 2.255Die LV findet vom 4. bis incl. 8.2.2013 (9-17 Uhr) im Seminarraum 2D404, UZA2 statt !
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Fr 07.09.2012 08:00 bis Mo 24.09.2012 18:00
- Abmeldung bis Di 30.10.2012 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine
Zur Zeit sind keine Termine bekannt.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
With the breakthrough of next generation DNA sequencing methods and their application to environmental samples, metagenomic and metatranscriptomic sequences have indelibly expanded the known DNA and protein sequence space to non-culturable micro-organisms and environmental communities. This practical seminar introduces the major computational methods necessary to process, analyse and interpret these sequences.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Report (to be written in workgroups).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Participants learn in this practical seminar how to pre-process environmental sequences (i.e. estimation and correction of sequencing errors), how to estimate taxonomic diversity in metagenomic and metatranscriptomic samples and how to investigate the function and taxonomy of environmental sequences.
Prüfungsstoff
This practical seminar will consist of theoretical (lecture like) introductions to the topics, discussion of selected scientific papers and practical exercises in the computer room.
Literatur
Will be provided during the seminar.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MOE W-5, MMB W-2, MMB W-3, MMI III-1
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43