Universität Wien FIND

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300311 VO Bioinformatik für die Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome (2021W)

4.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
VOR-ORT

An/Abmeldung

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Details

Sprache: Deutsch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Dienstag 05.10. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 12.10. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 19.10. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 09.11. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 16.11. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 23.11. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 30.11. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 07.12. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 11.01. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
Dienstag 18.01. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Diese Vorlesung gibt einen Überblick über Methoden der Bioinformatik zur Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome. Es werden sowohl etablierte Methoden und Werkzeuge, z.B. zur Genvorhersage oder zur funktionellen und strukturellen Klassikation von Proteinen, als auch neu entwickelte Methoden, z.B. zur Funktionszuordnung durch genomische Assoziationen, erläutert und diskutiert. Praktische Übungen demonstrieren den Einsatz ausgewählter Bioinformatik-Programme für typische Problemstellungen.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Termine der schriftlichen Abschlussklausuren (open-book: alle schriftlichen/gedruckten Hilfsmittel dürfen verwendet werden):
25.1.2022 11.30-13.00
März 2022, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA
Mai 2022, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA
Juni 2022, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verstehen typischer Problemstellungen der mikrobiellen Genomik, Metagenomik und Metatranskriptomik. Anwendung bioinformatischer Methoden zur Lösung dieser Probleme und Interpretation der Ergebnisse im biologischen Kontext.

Beurteilungsmaßstab der schriftlichen Klausur:
<50%: 5
<62.5%: 4
<75%: 3
<87.5%: 2
>=87.5%: 1

Prüfungsstoff

Vortrag und Erörterung/Diskussion von ausgewählten Themen. Unterrichtssprache Deutsch, mit englischsprachigen Materialien. Haus-Übungen.

Literatur

Wird in der Lehrveranstaltung auf der elearning Plattform bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BOE 9, BAN 6, BBO 8, BMG 10, BMB 10, BPB 11, BZO 11, UF BU 10

Letzte Änderung: Fr 08.10.2021 11:29