300313 SE Bioinformatik für Funktionelle Genomik (2010W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Vorbesprechung am 10.1.2011, 17 Uhr im Besprechungsraum Ökologie (Raum 2255).
Die LV findet vom 14.2. -18.2.2011 je 9-17 Uhr im Konferenzraum Ökologie (UZA1 2.241 1.OG) und Computerraum (Bereich Ökologiezentrum) statt !
Die LV findet vom 14.2. -18.2.2011 je 9-17 Uhr im Konferenzraum Ökologie (UZA1 2.241 1.OG) und Computerraum (Bereich Ökologiezentrum) statt !
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 09.09.2010 09:00 bis Mo 27.09.2010 17:00
- Abmeldung bis Sa 30.10.2010 23:00
Details
max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine
Zur Zeit sind keine Termine bekannt.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Report (to be written in workgroups).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Gaining the theoretical background to understand the basic principles of bioanalytical methods and related bioinformatic approaches; practical application of popular software tools to sample data (e.g. raw data from important publications), critical evaluation and interpretation of results.
Prüfungsstoff
Literature seminars on relevant papers, practical work using programs like Galaxy, BFAST, BWA, J-Express, Bioconductor, STRING.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MOE W-5, MMI III-1, MMB W-2, MMB W-3
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43
(also short discussion of ChIP-Seq)
2) Functional genomics on RNA level: Microarrays, SAGE, RNASeq; Data normalization, differential expression, clustering, GSEA and pathway analysis
3) Functional genomics on protein level: protein-protein interaction screening, protein identification, data integration and interaction networks