Universität Wien

300354 UE Molecular phylogenetics (2014W)

Phylogenetic (and other ) analyses using BEAST

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

The initial meeting will be on 15. Oct., 12:00-13:00, ÜR 1.
Planned dates for the course (determined by the availability of rooms):
20.10., 21.10., 27.10., 28.10., 17.11., 18.11., 15.12., 16.12.

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Mittwoch 15.10. 12:00 - 13:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 20.10. 10:00 - 16:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Dienstag 21.10. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 27.10. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Dienstag 28.10. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 17.11. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Dienstag 18.11. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 15.12. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Dienstag 16.12. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 29.01. 10:00 - 16:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Freitag 30.01. 10:00 - 16:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Evolutionary analyses using free software packages (mainly, but not only BEAST [Bayesian Evolutionary Analysis by Sampling Trees]) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and phylogeographic analysis.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

active participation (100%)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Students are acquainted with relevant software packages (e.g., BEAST) and their underlying theoretical background and can apply those to address evolutionary questions (such as phylogeny reconstruction, molecular dating, phylogeographic analyses).

Prüfungsstoff

Presentation (20%) and practical exercise (80%)

Literatur

http://beast2.org/book.html
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MBO5, MPF W-1, MEV W-6

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43