Universität Wien FIND

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300354 UE Molecular phylogenetics and phylogenomics (2019W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Details

max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Initial meeting is on 11. Oct., 9-10:00

Freitag 11.10. 09:00 - 10:00 Hörsaal (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg EG
Donnerstag 24.10. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 21.11. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 28.11. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 05.12. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 12.12. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 16.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 23.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 30.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Evolutionary analyses using free software packages (e.g., PAUP, RAxML, BEAST) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and analysis of phylogenomic data, including coalescent methods.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

One home exercise per unit, each to be documented in the form of a short and concise protocol. Each protocol can get (on average) maximally 5 points, totaling 40 points for the entire course.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Minimum requirement for positive credit: 20.5 points
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)

Prüfungsstoff

Presentation (20%) and practical exercise (80%)

Literatur

http://beast2.org/book.html
https://paup.phylosolutions.com
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MBO 5, MZO 2, M-WZB

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:22