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Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

300362 UE Applied Data Analysis (2019S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Verpflichtende Vorbesprechung/ Compulsory preliminary meeting am 10.04.2019 um 12 Uhr im COSB Seminarraum, Biozentrum Althanstraße 14, 1090 Wien
The course is planned for 10 days total over the course of 3 weeks of half-day lecturing and supervised project work/discussion beginning sometime soon after Easter, depending on the time requirements of the majority of participants.

Mittwoch 10.04. 12:00 - 13:00 COSB-Seminarraum
Montag 29.04. 10:00 - 18:00 COSB-Seminarraum
Dienstag 30.04. 10:00 - 18:00 Übungsraum 2
Donnerstag 02.05. 10:00 - 18:00 Übungsraum 2
Freitag 03.05. 10:30 - 18:30 Konferenzraum
Montag 06.05. 10:00 - 18:00 COSB-Seminarraum
Dienstag 07.05. 10:00 - 18:00 Übungsraum 3
Freitag 10.05. 10:30 - 18:30 Konferenzraum
Montag 13.05. 09:00 - 16:00 Konferenzraum
Freitag 17.05. 10:30 - 18:30 Konferenzraum
Montag 20.05. 09:00 - 16:00 Konferenzraum

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

In this course we will learn about modern high-throughput methodologies and get hands-on experience with new methods and real data. We will discuss sequencing technology, experiment design, quality control, read mapping and counting, differential expression analysis, expression profiles and principal components analysis.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Exercises will be done throughout the course as a part of a collective analysis.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.

Prüfungsstoff

A final report describing the methods used as well as an analysis of the data will be required after completion of the course. Attendance and participation are also graded.

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MES6, MMEI III, MGE III-2, MMB W-2, MMB W-3, M-WZB

Letzte Änderung: Sa 22.10.2022 00:30