300362 UE Applied Data Analysis (2021S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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VOR-ORT
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 11.02.2021 08:00 bis Do 25.02.2021 18:00
- Abmeldung bis Mi 31.03.2021 18:00
Details
max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Dear students,
Due to the uncertainty of the teaching situation in the summer semester we will have (likely) an online get-together on Wednesday March 17th at 3pm. We will then confirm 10 days, likely in April after Easter) of the course to take place either online (like last year) or, hopefully and more fun, in-person!
Dienstag
13.04.
09:00 - 17:00
Übungsraum 2
Mittwoch
14.04.
09:00 - 12:00
Übungsraum 3
Mittwoch
14.04.
12:00 - 17:00
Übungsraum 4
Donnerstag
15.04.
09:00 - 17:00
Übungsraum 2
Freitag
16.04.
09:00 - 13:00
Übungsraum 2
Freitag
16.04.
13:00 - 17:00
Übungsraum 4
Dienstag
20.04.
09:00 - 17:00
Übungsraum 2
Mittwoch
21.04.
09:00 - 12:00
Übungsraum 3
Mittwoch
21.04.
12:00 - 17:00
Übungsraum 4
Donnerstag
22.04.
09:00 - 17:00
Übungsraum 2
Freitag
23.04.
09:00 - 13:00
Übungsraum 2
Freitag
23.04.
13:00 - 17:00
Übungsraum 4
Dienstag
27.04.
09:00 - 17:00
Übungsraum 2
Mittwoch
28.04.
12:00 - 17:00
Übungsraum 4
Donnerstag
29.04.
09:00 - 17:00
Übungsraum 3
Freitag
30.04.
09:00 - 12:00
Übungsraum 3
Freitag
30.04.
13:00 - 17:00
Übungsraum 4
Dienstag
04.05.
09:00 - 12:00
Übungsraum 3
Dienstag
04.05.
13:00 - 17:00
Übungsraum 4
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
In this course we will learn about modern high-throughput methodologies and get hands-on experience with new methods and real data. We will discuss sequencing technology, experiment design, quality control, assembly, read mapping and counting, differential expression analysis, expression profiles and principal components analysis.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Exercises will be done throughout the course as a part of a collective analysis.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
There are 10 days of the course. Presence on at least 8 days is required. The grade will be based on course participation (20%) and the final report in a form of a scientific paper outlining the aims and analyses completed during the course, as well as potential future directions (80%).
Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.
Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.
Prüfungsstoff
A final report describing the methods used as well as an analysis of the data will be required after completion of the course. Attendance and participation are also graded.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MES6, MMEI III, MGE III-2, MMB W-2, MMB W-3, M-WZB
Letzte Änderung: Sa 22.10.2022 00:30