Universität Wien

300484 UE Practical Course in Molecular Microbiology, Microbial Ecology and Immunobiology (2014W)

Diversity and function of uncultured microbes in medical and environmental samples

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine

1. Vorbesprechungstermin: 19. November 2014, 10:00 Uhr im Seminarraum der Division Mikrobielle Ökologie (Raum 2.309),
2. Vorbesprechungstermin: 16. Januar 2015, 13:00 Uhr im Seminarraum der Division Mikrobielle Ökologie (Raum 2.309),

Dauer: 02.02.2015 bis 13.02.2015 jeweils 9.00-18.00 Uhr (Blockveranstaltung)


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Course goals: In this course you will learn modern methods fur studying microorganisms without cultivation, including how to identify microorganisms and visualize them directly in medical and environmental samples and how to study the activity and function of organisms in complex microbial communities.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Art der Leistungskontrolle: Benotung beruht auf drei Teilleistungen: praktische Arbeit im Labor, Seminar, und abschliessende Presentation (inkl. kurzer mündl. Prüfung). Die erfolgreiche Absolvierung der LV erfordert positive Beurteilungen für alle drei Teilleistungen.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Methods: Theoretical knowledge will be disseminated through lectures (PowerPoint Presentations), the course handout and original literature. Supervised hands-on training in independent experiments will teach you how to identify microorganisms through 16S rRNA gene/transcript analysis and fluorescence in situ hybridization techniques (FISH/ CARD-FISH). You will further learn about the use of functional genes/transcripts to identify microorganisms involved in a certain function, and how to investigate their activity with stable isotope probing incubations followed by Raman microspectroscopy. The theoretical principles of high-resolution secondary ion mass spectrometry (NanoSIMS) coupled to stable isotope incubations will also be discussed.
The course includes computer-based sequence analysis as well as presentations and discussion of the results in student seminars.

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMEI I, MEC-9, MOE III-3

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43