Universität Wien FIND

301214 UE Toolkit für in silico Sequenzanalysen (2021W)

vormals UE IIIB

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT

Zusammenfassung

1 Eislmayr , Moodle
2 Kovarik , Moodle
3 Dammermann , Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.

Gruppen

Gruppe 1

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung 7.10.2021, 12:00 - 13:00 online
(invitation to the online meeting sent to registered students)

Termin: 8. - 12.11.2021 9.00 - 17.00 Uhr

Wenn die Lehrveranstaltung bereits im Bachelorstudium absolviert wurde, kann sie im Masterstudium (A 066830, A 066 834, A 066 877) nicht anerkannt werden.
Voraussetzung ist die VO Genexpression(Bachelor Biologie)

Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/

Donnerstag 07.10. 12:00 - 13:00 BZB/Seminarraum 1/2, 6.Ebene 6.501/6.504, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien (Vorbesprechung)
Montag 08.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Dienstag 09.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Mittwoch 10.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Donnerstag 11.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Freitag 12.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien

Gruppe 2

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung 7.10.2021, 12:00 - 13:00 online
(invitation to the online meeting sent to registered students)

Termin: 15.-19.11.2021, 9.00 - 17.00 Uhr
Ort: BZB, EDV-Kursraum, Dr. Bohrgasse, 1030 Wien

Wenn die Lehrveranstaltung bereits im Bachelorstudium absolviert wurde, kann sie im Masterstudium (A 066830, A 066 834, A 066 877) nicht anerkannt werden.
Voraussetzung ist die VO Genexpression(Bachelor Biologie)

Siehe auch Studentenseite der Departments: http://molekularebiologie.univie.ac.at/

Donnerstag 07.10. 12:00 - 13:00 BZB/Seminarraum 1/2, 6.Ebene 6.501/6.504, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
Montag 15.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Dienstag 16.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Mittwoch 17.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Donnerstag 18.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Freitag 19.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien

Gruppe 3

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung 7.10.2021, 12:00 -13:00 online
(invitation to the online meeting sent to registered students)

13. - 17.12.2021, 9.00 - 17.00 Uhr

Wenn die Lehrveranstaltung bereits im Bachelorstudium absolviert wurde, kann sie im Masterstudium (A 066830, A 066 834, A 066 877) nicht anerkannt werden.
Voraussetzung ist die VO Genexpression(Bachelor Biologie)

Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/

Donnerstag 07.10. 12:00 - 13:00 BZB/Seminarraum 1/2, 6.Ebene 6.501/6.504, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
Montag 13.12. 08:55 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Dienstag 14.12. 08:55 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Mittwoch 15.12. 08:55 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Donnerstag 16.12. 08:55 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Freitag 17.12. 08:55 - 17:00 BZB/Seminarraum 4, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Ziele:
Erwerben von Fähigkeiten, Datenbanken für Genom-, DNA-, RNA- und Protein-Sequenzen zu verwenden und diese Sequenzen für die grundlegenden Aufgaben der molekularbiologischen Forschung zu analysieren.
Inhalte:
Suche und Findung von Sequenzen; Sequenzvergleich und Analyse von Homologien; Identifikation von Proteindomänen mittels „multiple sequence alignment“; in silico Plasmidklonierung; Design von Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9; Design von Primern für qPCR, PCR; Analyse von qPCR-Experimenten; Proteinstrukturen
Methoden:
Praktische Übung am Computer

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Aktive Teilnahme und Lösung von Aufgaben Versuche, schriftliches Protokoll und Abschlussprüfung.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Beurteilt wird: Aktive Mitarbeit, Protokoll, Abschlussprüfung
Gesamtbeurteilung: aktive Mitarbeit 25%, Protokoll 25%, Abschlussprüfung 50%
Jede der Teilleistungen muss positiv sein.

Prüfungsstoff

Inhalt der Übungseinheiten

Literatur

Unterlagen und Programm in Moodle; Originalliteratur auf den Web-Seiten der Datenbanken und Web-Services

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I-2, MMB II-2, MMB III-2, MMB W-2, MGE III-1, MGE III-2, MMEI III

Letzte Änderung: Di 29.11.2022 16:30