Universität Wien

301214 UE Toolkit für in silico Sequenzanalysen (2024S)

vormals UE IIIB

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Zusammenfassung

1 Zeiler , Moodle
2 Chen , Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.

Gruppen

Gruppe 1

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung: 11.3 2024, 10.00 Uhr via Zoom
Ort : VBC 5 Hörsaal B/ Room 1.210
Termin: 13.- 17.5.2024 ganztägig

  • Montag 13.05. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Dienstag 14.05. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Mittwoch 15.05. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Donnerstag 16.05. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Freitag 17.05. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien

Gruppe 2

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung: 11.3.2024, 10.00 Uhr via zoom
Termin: 17.- 21.Juni 2024 ganztägig

  • Montag 17.06. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Dienstag 18.06. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 19.06. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Donnerstag 20.06. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Freitag 21.06. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Ziele: Erwerben von Fähigkeiten, Datenbanken für Genom-, DNA-, RNA- und Protein-Sequenzen zu verwenden und diese Sequenzen für die grundlegenden Aufgaben der molekularbiologischen Forschung zu analysieren.
Inhalte: Suche und Findung von Sequenzen; Sequenzvergleich und Analyse von Homologien; Identifikation von Proteindomänen mittels multiple sequence alignment; in silico Plasmidklonierung; Design von Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9; Design von Primern für qPCR, PCR; Analyse von qPCR-Experimenten; Proteinstrukturen
Methoden: Praktische Übung am Computer

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Art der Leistungskontrolle: Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme und Lösung von Aufgaben Versuche, schriftliches Protokoll und Abschlussprüfung.
erlaubte Hilfsmittel: eigene Notizen und Mitschrift, Computer, Internet

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Mindestanforderung: Anwesenheit, Abgabe des Protokolls, Abschlussprüfung (jede der Teilleistungen muss positiv sein).
Beurteilungsmaßstab: aktive Mitarbeit 25%, Protokoll 25%, Abschlussprüfung 50%

Prüfungsstoff

Inhalt der Übungseinheiten

Literatur

Beschreibungen und Referenzen der Originalliteratur auf den Web-Seiten der Datenbanken und Web-Services

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II., MMEI III

Letzte Änderung: Di 16.04.2024 15:46