Universität Wien

301503 UE Practical Skills for Microbiome Science II (2025W)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Für diese LV muss vor Kursbeginn (nach Ablauf der Anmeldephase und Aufnahme der Studierenden) eine verpflichtende Sicherheitsunterweisung absolviert werden. Der link zum entsprechenden Moodle-Kurs wird ihnen nach Aufnahme in den Kurs zugesendet.
Alle Übungsräume dürfen ausschließlich mit Labormantel und geschlossenen Schuhen betreten werden, falls benötigt, muss eine Laborbrille angeschafft werden - Privatsachen bitte in den Garderoberäumen verstauen.
There will be a mandatory safty instruction for this course. After the registration period, the admitted students have to complete this instruction. The link to the corresponding Moodle course will be sent to you after you have been accepted to the course.
All practice rooms may only be entered with a lab coat and closed shoes, and, if needed, lab glasses must also be purchased - please store private belongings in the cloakroom.
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Moodle
Mo 09.02. 08:00-18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Ort: UBB, Djerassiplatz 1, 1030 Wien

Vorbesprechung (organizational meeting):
Wednesday, December 17 at 10:30-11.00 am in UBB 2.129, Seminar Room 2.1 (2nd floor). The meeting will be hybrid – both in person and via Zoom (see link below). In case you cannot participate in the meeting, please let us know.

https://univienna.zoom.us/j/68676331545?pwd=8nxr10Ue1iqXpuxBPzbObwMQsPyds4.1
Meeting ID: 686 7633 1545
Passcode: 800891

  • Dienstag 10.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Mittwoch 11.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Donnerstag 12.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Freitag 13.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Montag 16.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Dienstag 17.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Mittwoch 18.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Donnerstag 19.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Freitag 20.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Montag 23.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Dienstag 24.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Mittwoch 25.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Donnerstag 26.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1
  • Freitag 27.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
    Übungsraum 1.6 Molekularbiologie 1, Biologie Djerassiplatz 1, 1.043, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

The overarching goal of this course is to learn how we can study microbiomes, including the limitations. The learning objectives for this course are: (1) conceptual understanding of microbial consortia and methods to investigate them and (2) develop technical skills in the lab stemming from basic microbiology to molecular biology and bioinformatic skills. The students will learn such concepts as (1) understanding factors that govern a microbe’s/microbial consortium’s success in the environment, (2) methods to measure their growth/activity, (3) understanding the basic nutrients a cell needs for growth, (4) experimental design concept and (5) documentation of experiments and results. Technical skills include basic microbiology skills, molecular biology skills, single-cell analysis and basic microscopy, along with basic bioinformatic skills.

Methods: The course will be composed mainly of practical experiments, combined with short lectures.
Supervised hands-on training in independent experiments will teach you how to enrich for a targeted physiology, evaluate the function of that enrichment and characterize the community via amplicon sequencing analysis, digital PCR and fluorescence in situ hybridization techniques (FISH). You will further isolate representative strains from the enrichments and characterize the organisms. The course includes computer-based sequence analysis as well as presentations and discussion of the results.
Theoretical knowledge will be disseminated through lectures, data and theoretical discussion sessions in the lab and the course handouts.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Evaluation will have four parts: (1) practical participation in the lab, (2) weekly quizzes, (3) final presentation and (4) written report.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Active participation in lab experiments, positive evaluations in weekly quizzes, final presentation, as well as written protocol.

Prüfungsstoff

As above described under Methods.

Literatur

Brock Biology of Microorganisms
Further literature will be provided during the course.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMIC 1

Letzte Änderung: Mi 26.11.2025 13:07