560060 UE UE in Fluoreszenz und Konfokalmikroskopie inkl.Übungen zur Bild-bearbeitung/analyse (2021S)
Vienna Biocenter PhD Program
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Labels
GEMISCHT
Zusammenfassung
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 11.02.2021 08:00 bis Do 25.02.2021 18:00
- Abmeldung bis Mi 31.03.2021 18:00
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.
Gruppen
Gruppe 1
In case non-German speaking students participate we, of course, will teach in English!
max. 8 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch
Lernplattform: Moodle
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
-hybride Lehre-
Vorbesprechung (DIGITAL): Mi,17.3.2021, 10:30-11:00 Uhr, (pünktlich!): als DIGITALES COLLABORATE MEETING:https://eu.bbcollab.com/guest/119d87fc7fba4669a6b0f59062112d0f
Teilnahmepflicht bei der Vorbesprechung !!Die Anmeldung über U:Space für EINE der beiden angebotenen Gruppen ist ausreichend!!Die Anmeldung über U:Space bedingt NICHT zwingend auch eine Teilnahmeberechtigung!Im Falle einer Überbuchung behält sich der Kursleiter das Recht vor, basierend auf den Karrierestatus und der Notwendigkeit des Kursinhalts (z.B. für laufende Master/PhD-Arbeiten) die Teilnehmer zu selektieren.Beschränkte Teilnehmerzahl: 8Details zu Programm und Ablauf in Vorbesprechung.Termin(e): Abhaltungstermine für beide Kurse : 18.-20.Mai; 26.+27.Mai; 1.+2.Juni; 8.+9.Juni
PHYSISCHE Anwesenheit nur erforderlich:
Kurs 1 26., 27. Mai; 8.Juni.
Kurs 2 26.+27.Mai; 8.Juni
Ort: MPL-VBC5, level E1, Dr. Bohrg. 9, 1030 Wien.To participate in on-site courses and exams, you have to present a negative COVID-19 test result. Accepted tests and confirmations are:
Antigen test by a recognised test centre: Sample taken no more than 48 hours before the course unit/exam,
PCR test by a recognised test centre, including “Alles gurgelt” (everybody gargle): Sample taken no more than 72 hours before the course unit/exam,
PCR test for employees at the University of Vienna: Sample taken no more than 72 hours before the course unit/exam,
laboratory test for neutralising antibodies against COVID-19: valid for three months from the date of the test
Medical certificate of recovery from a COVID-19 infection within the past six months before the course unit/exam or
Official order ("Absonderungsbescheid") after the period of quarantaine within the past six months before the course unit/exam
Please have your confirmation/test result ready during your stay at the University. You may be asked to present it. The document remains with you.
If you cannot present a valid confirmation/test result, you are not allowed to participate in on-site courses/exams.
You can find recognised test centres under Österreich testet
Make use of the “Alles gurgelt” (everybody gargle) campaign.UPDATE NOV 19th:
For participation on-site to all physical presence units EVERYBODY has to provide a PCR test certificate NO LONGER than 48 hours old. THIS ALSO APPLIES FOR VACCINATED AND RECOVERED PERSONS!
- Dienstag 18.05. 10:30 - 12:30 Digital
- Mittwoch 19.05. 10:00 - 12:00 Digital
- Donnerstag 20.05. 10:30 - 12:30 Digital
- Mittwoch 26.05. 09:30 - 17:30 Hybride Lehre
- Donnerstag 27.05. 09:30 - 17:30 Hybride Lehre
- Dienstag 08.06. 10:00 - 15:00 Hybride Lehre
- Mittwoch 09.06. 10:00 - 15:00 Hybride Lehre
Gruppe 2
In case non-German speaking students participate we, of course, will teach in English!
max. 8 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch
Lernplattform: Moodle
Lehrende
Termine
-hybride Lehre-
Termine siehe Gruppe 1
-hybride Lehre-
LINK: https://eu.bbcollab.com/guest/119d87fc7fba4669a6b0f59062112d0f
Teilnahmepflicht bei der Vorbesprechung !!Die Anmeldung über U:Space für EINE der beiden angebotenen Gruppen ist ausreichend!!Die Anmeldung über U:Space bedingt NICHT zwingend auch eine Teilnahmeberechtigung!Im Falle einer Überbuchung behält sich der Kursleiter das Recht vor, basierend auf den Karrierestatus und der Notwendigkeit des Kursinhalts (z.B. für laufende Master/PhD-Arbeiten) die Teilnehmer zu selektieren.Beschränkte Teilnehmerzahl: 8Details zu Programm und Ablauf in Vorbesprechung.Termin(e): Abhaltungstermine für beide Kurse : 18.-20.Mai; 26.+27.Mai; 1.+2.Juni; 8.+9.Juni
PHYSISCHE Anwesenheit nur erforderlich:
Kurs 1 26., 27. Mai; 8.Juni.
Kurs 2 26.+27.Mai; 8.Juni
Ort: MPL-VBC5, level E1, Dr. Bohrg. 9, 1030 Wien.To participate in on-site courses and exams, you have to present a negative COVID-19 test result. Accepted tests and confirmations are:
Antigen test by a recognised test centre: Sample taken no more than 48 hours before the course unit/exam,
PCR test by a recognised test centre, including “Alles gurgelt” (everybody gargle): Sample taken no more than 72 hours before the course unit/exam,
PCR test for employees at the University of Vienna: Sample taken no more than 72 hours before the course unit/exam,
laboratory test for neutralising antibodies against COVID-19: valid for three months from the date of the test
Medical certificate of recovery from a COVID-19 infection within the past six months before the course unit/exam or
Official order ("Absonderungsbescheid") after the period of quarantaine within the past six months before the course unit/exam
Please have your confirmation/test result ready during your stay at the University. You may be asked to present it. The document remains with you.
If you cannot present a valid confirmation/test result, you are not allowed to participate in on-site courses/exams.
You can find recognised test centres under Österreich testet
Make use of the “Alles gurgelt” (everybody gargle) campaign.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
oral exam and continuous assessment
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
The aim of the course is to give theoretical and practical support to students, who are or will in the near future be involved with light microscopical experiments within their Master/PhD/post-doc studies. The small groups (2 people) will allow to advice students somehow personally for their planned experimental approaches.
Prüfungsstoff
microscopy sample preparation
widefield fluorescence microscopy (incl. Köhler and contrast enhancement)
measuring point spread function and chromatic aberration
confocal microscopy
image processing using "huygens" and ImageJ software
widefield fluorescence microscopy (incl. Köhler and contrast enhancement)
measuring point spread function and chromatic aberration
confocal microscopy
image processing using "huygens" and ImageJ software
Literatur
J.Pawley, Handbook of Biological Confocal Microscopy, Springer, 2006
Yuste, Imaging – A Laboratory manual; CSHL-Press, 2010
D.B.Murphy, Fundamentals of Light Microscopy and Electronic Imaging, Wiley, 2001 / 2009
E.M.Goldys, Flurescence Applications in Biotechnology and the Life Sciences, Wiley, 2009
Kevin F. Sullivan, Fluorescent Proteins (Methods in Cell Biology) , Academic Press, 2008
Yuste, Imaging – A Laboratory manual; CSHL-Press, 2010
D.B.Murphy, Fundamentals of Light Microscopy and Electronic Imaging, Wiley, 2001 / 2009
E.M.Goldys, Flurescence Applications in Biotechnology and the Life Sciences, Wiley, 2009
Kevin F. Sullivan, Fluorescent Proteins (Methods in Cell Biology) , Academic Press, 2008
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
PhD-MB 2, MMEI III, MMB W-2, WZB
Letzte Änderung: Fr 12.05.2023 00:27
Technische Erläuterung der verwendeten Geräte
Laborübungen Probenvorbereitungen
Qualitätskriterien Aberrationskorrekturen
Mikroskopieren von ausgewählten Proben mittels Fluoreszenz- und Konfokalmikroskopie (Mehrkanalaufnahmen, serielle optische Schnitte durch Proben, Bildprojektionen, Aufnehmen von Zeitserien)Bildanalyse und Dekonvolution von eigens angefertigten Bildern