Universität Wien
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300041 VO Biodiversity and molecular ecology of microorganisms (2026S)

5.00 ECTS (4.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Moodle

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Details

Language: German

Examination dates

Lecturers

Classes (iCal) - next class is marked with N

  • Monday 02.03. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 04.03. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 09.03. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 11.03. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 16.03. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 18.03. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 23.03. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 25.03. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 13.04. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 15.04. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 20.04. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 22.04. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 27.04. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 29.04. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 04.05. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 06.05. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 11.05. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 13.05. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 18.05. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 20.05. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 27.05. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 01.06. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 03.06. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 08.06. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 10.06. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 15.06. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 17.06. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 22.06. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Wednesday 24.06. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Monday 29.06. 11:30 - 13:00 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0

Information

Aims, contents and method of the course

Die Studierenden erhalten einen detaillierten Überblick über bewährte sowie hochaktuelle Technologien in der mikrobiellen Ökologie/Umweltmikrobiologie und lernen deren jeweilige Vorteile, Einsatzgebiete und Limitationen kennen. Darüber hinaus werden die Studierenden mit aktuellen Forschungsergebnissen vertraut gemacht und erlangen Einblicke in die Biologie ausgewählter mikrobieller Lebensgemeinschaften und funktionell wichtiger Mikroorganismen.

Der erste Teil der Vorlesung (Alexander Loy) befasst sich umfassend mit molekularbiologischen Methoden zur Untersuchung der Zusammensetzung mikrobieller Lebensgemeinschaften in komplexen Umwelt- und medizinischen Proben. Im Anschluss an eine Einführung zum Artkonzept in der Mikrobiologie, sowie einer Beschreibung der Parameter mikrobieller Diversität (species richness und evenness), wird der vollständige rRNS-Ansatz im Detail behandelt. Weitere molekulare Techniken, die im Rahmen der Lehrveranstaltung anhand ausgewählter Anwendungsbeispiele vorgestellt und kritisch hinsichtlich ihrer Tauglichkeit zur Identifizierung bzw. Quantifizierung von Mikroorganismen diskutiert werden, sind u.a. Fluoreszenz in situ Hybridisierung, quantitative real-time PCR und neue Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien (z.B. Illumina).

Der zweite Teil dieser Vorlesung (Holger Daims) befasst sich umfassend mit molekularbiologischen und Isotopen-basierten Methoden zur funktionellen Analyse von Mikroorganismen in komplexen Umweltproben. Beispiele umfassen die Analyse von Funktionsgenen, Raman-Mikrospektroskopie und Stable Isotope Probing. Weiterhin werden auf Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung beruhende Techniken zur Charakterisierung mikrobieller Lebensgemeinschaften auf genomischer Ebene (Metagenomik, Einzelzellgenomik) vorgestellt. Anwendung und Erfolg dieser Ansätze werden stets an Beispielen aus der Forschung in der mikrobiellen Ökologie und Mikrobiologie erläutert. Parallel zu den methodischen Aspekten wird die Diversität, Ökologie und Physiologie funktionell wichtiger Mikroorganismen in technischen und natürlichen Ökosystemen behandelt. Schließlich werden innovative Ansätze zur Kultivierung von Mikroorganismen vorgestellt, welche die molekularbiologischen Methoden ergänzen.

Vermittlung von theoretischem Wissen über Vorlesungen (PowerPoint Präsentationen) und Primärliteratur. Demonstrationen von molekularen Techniken mittels Animationen, Lehrfilm, und technischem Anschauungsmaterial.

Vorlesungsfolien und weitere Unterrichtsmaterialien werden auf Moodle bereitgestellt.

Assessment and permitted materials

Multiple Choice Prüfung der LV-Inhalte.
Die Prüfung wird im closed-book Format in Person durchgeführt.

Minimum requirements and assessment criteria

Für eine positive Beurteilung ist das Erreichen einer Mindestpunktzahl (50% der Punkte) in der schriftlichen Prüfung erforderlich. Die Note ergibt sich aus der Anzahl der erreichten Punkte.

Examination topics

Der gesamte Inhalt aller Vorlesungen ist prüfungsrelevant.
Die Vortragsfolien und andere Unterrichtsmaterialien werden über Moodle zum Download oder zur Einsicht bereitgestellt.

Reading list

Primärliteratur erhältlich über
NCBI PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=PubMed
Google Scholar https://scholar.google.com/

Wikipedia (Informationen immer mit der Primärliteratur abgleichen!) http://www.wikipedia.org/

Brock - Biology of Microorganisms - Global edition - latest edition
https://elibrary.pearson.de/book/99.150005/9781292405063)

Allgemeine Mikrobiologie
Fuchs G, Hrsg. 11., vollständig überarbeitete Auflage. Stuttgart: Thieme; 2021. doi:10.1055/b000000100
https://eref-thieme-de.uaccess.univie.ac.at/ebooks/cs_16881198#/ebook_cs_16881198__Ref64375187
Freier Zugang über U:access

Principles of Microbial Metabolism and Metabolic Ecology
https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-031-28218-8
Freier Zugang über U:access

Methods for General and Molecular Microbiology
Editor(s):C. A. Reddy, T. J. Beveridge, J. A. Breznak, G. A. Marzluf, T. M. Schmidt, L. R. Snyder
Print ISBN:9781119739159 |Online ISBN:9781683671619 |DOI:10.1128/9781555817497
https://onlinelibrary-wiley-com.uaccess.univie.ac.at/doi/book/10.1128/9781555817497
Freier Zugang über U:access

Association in the course directory

UF BU 10, BOE 5, BAN 6, BPB 11, BBO 8, BZO 11, BMB 10, BMG 10

Last modified: Mo 27.07.2026 09:27