300609 VO Biodiversity and molecular Ecology of Micororganisms 2 (2018S)

Der zweite Teil dieser Vorlesung (der erste Teil findet im Wintersemester statt) befasst sich umfassend mit molekularbiologischen und Isotopen-basierten Methoden zur funktionellen Analyse von Mikroorganismen in komplexen Umweltproben. Beispiele umfassen die Analyse von Funktionsgenen, FISH-Mikroautoradiographie und Stable Isotope Probing. Weiterhin werden auf Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung beruhende Techniken zur Charakterisierung mikrobieller Lebensgemeinschaften auf genomischer Ebene (Metagenomik) und im Hinblick auf die Genexpression (Metatranskriptomik) vorgestellt. Anwendung und Erfolg dieser Ansätze werden an Beispielen mikrobieller Lebensgemeinschaften, z.B. in Kläranlagen und den Ozeanen, erläutert. Parallel zu den methodischen Aspekten wird die Diversität, Ökologie und Physiologie funktionell wichtiger Schlüsselorganismen in diesen Lebensgemeinschaften behandelt. Schließlich werden innovative Ansätze zur Kultivierung von Mikroorganismen vorgestellt, welche die molekularbiologischen Methoden ergänzen.
Die Teilnehmer dieser Vorlesung erhalten einen detaillierten Überblick über bewährte sowie hochaktuelle Technologien in der mikrobiellen Ökologie/Umweltmikrobiologie und lernen deren jeweilige Vorteile, Einsatzgebiete und Limitationen kennen. Darüber hinaus werden die Teilnehmer mit aktuellen Forschungsergebnissen vertraut gemacht und erlangen Einblicke in die Biologie ausgewählter mikrobieller Lebensgemeinschaften und funktionell wichtiger Mikroorganismen.