053520 VU Algorithmische Bioinformatik (2024S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Mo 12.02.2024 09:00 bis Do 22.02.2024 09:00
- Abmeldung bis Do 14.03.2024 23:59
Details
max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Freitag
01.03.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
05.03.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
08.03.
09:00 - 11:15
Seminarraum 3, Währinger Straße 29 1.UG
Freitag
15.03.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
19.03.
09:15 - 11:15
Seminarraum 8, Währinger Straße 29 1.OG
Freitag
22.03.
09:45 - 11:15
Seminarraum 6, Währinger Straße 29 1.OG
Dienstag
09.04.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
12.04.
09:45 - 11:15
Seminarraum 6, Währinger Straße 29 1.OG
Dienstag
16.04.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
19.04.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
23.04.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
26.04.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
30.04.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
03.05.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
N
Dienstag
07.05.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
10.05.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
14.05.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
17.05.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
21.05.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
24.05.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
28.05.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
31.05.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
04.06.
09:15 - 11:15
Seminarraum 9, Währinger Straße 29 2.OG
Freitag
07.06.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Dienstag
11.06.
09:15 - 11:15
Seminarraum 3, Währinger Straße 29 1.UG
Freitag
14.06.
09:45 - 11:15
Seminarraum 2, Währinger Straße 29 1.UG
Dienstag
18.06.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
21.06.
09:45 - 11:15
Seminarraum 8, Währinger Straße 29 1.OG
Dienstag
25.06.
10:00 - 12:00
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Freitag
28.06.
09:30 - 11:30
STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Art der Leistungskontrolle: Im Laufe der VU sind Übungsabgaben zu lösen und via Moodle abzugeben. Die Übungen beinhalten das Implementieren von Algorithmen zur Lösung der Aufgaben. Zusätzlich müssen alle Studierende im Laufe der LV Lösungen an der Tafel präsentieren.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
a. Mindestanforderung: Anwesenheit während des Kurses, Präsentation von Ergebnissen, Übungsabgaben. Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.
b. Beurteilungsmaßstab: Die folgenden erreichten Prozentzahlen entsprechen den folgenden Noten:
>=87.5%: Note 1 (sehr gut)
<87.5%: Note 2 (gut)
<75.0%: Note 3 (befriedigend)
<62.5%: Note 4 (genügend)
<50.0%: Note 5 (nicht genügend)
b. Beurteilungsmaßstab: Die folgenden erreichten Prozentzahlen entsprechen den folgenden Noten:
>=87.5%: Note 1 (sehr gut)
<87.5%: Note 2 (gut)
<75.0%: Note 3 (befriedigend)
<62.5%: Note 4 (genügend)
<50.0%: Note 5 (nicht genügend)
Prüfungsstoff
Relevant sind alle in der Lehrveranstaltung, den Vorlesungen, den Hausübungen und den Übungsbesprechungen vorkommenden Inhalte.
Literatur
Nützliche Literatur für die LV ist "Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach" von Compeau und Pevzner, entweder die zweibändige Version from 2015 oder die Version von 2018 in einem Band.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
Module: BIOINF02
Letzte Änderung: Fr 26.04.2024 15:45
b. Inhalte: Die Lehrveranstaltung gibt einen Überblick über die verschiedenen Algorithmen-Klassen und deren Anwendung in der Bioinformatik wie Randomisierte Algorithmen, Graphen-Algorithmen, Brute Force Algorithmen, Dynamische Programmierung, Combinatorische Algorithmen, Evolutionaere Baum-Rekonstruktion, Clustering Algorithmen, Cominatorial Pattern Matching, Hidden Markov Modelle und Methoden der Computational Proteomics.
c. Methoden: Vorlesung, Hausübungen zu den einzelnen Vorlesungsthemen inklusive Programmierung, Hausübungs-Besprechungen mit Lösungpräsentation durch die Studierenden.
HINWEIS: Die Vorlesung und Hausübungs-Besprechungen werden je nach den aktuell geltenden Corona/COVID-19-Bestimmungen in präsenz, hybrid oder rein in distance learning online abgehalten werden.