053520 VU Algorithmische Bioinformatik (2021S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Mo 15.02.2021 09:00 bis Mo 22.02.2021 09:00
- Abmeldung bis So 14.03.2021 23:59
Details
max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine
VB: DI 02.03.2021 10.00-12.00 Ort: STB/Hörsaal A+B Strukturchemie Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien (möglicherweise online); DI wtl von 02.03.2021 bis 29.06.2021 10.00-12.00 Ort: STB/Hörsaal A+B Strukturchemie Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien; FR wtl von 05.03.2021 bis 25.06.2021 9.30-11.30 Ort: STB/Hörsaal A+B Strukturchemie Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
HINWEIS: Die Vorbesprechung, Vorlesung und Hausübungs-Besprechungen werden je nach der aktuellen Situation und den geltenden Corona/COVID-19-Bestimmungen in präsenz, hybrid oder rein in distance learning online abgehalten werden.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Art der Leistungskontrolle: Im Laufe der VU sind Übungsabgaben zu lösen und via Moodle abzugeben. Die Übungen beinhalten das Implementieren von Algorithmen zu Lösung der Aufgaben. Zusätzlich müssen alle Studierende im Laufe der LV Lösungen an der Tafel präsentieren.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
a. Mindestanforderung: Anwesenheit während des Kurses, Präsentation von Ergebnissen, Übungsabgaben. Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.
b. Beurteilungsmaßstab: Die folgenden erreichten Prozentzahlen entsprechen den folgenden Noten:
>=87.5%: Note 1 (sehr gut)
<87.5%: Note 2 (gut)
<75.0%: Note 3 (befriedigend)
<62.5%: Note 4 (genügend)
<50.0%: Note 5 (nicht genügend)
b. Beurteilungsmaßstab: Die folgenden erreichten Prozentzahlen entsprechen den folgenden Noten:
>=87.5%: Note 1 (sehr gut)
<87.5%: Note 2 (gut)
<75.0%: Note 3 (befriedigend)
<62.5%: Note 4 (genügend)
<50.0%: Note 5 (nicht genügend)
Prüfungsstoff
Relevant sind alle in der Lehrveranstaltung, den Vorlesungen, den Hausübungen und den Übungsbesprechungen vorkommenden Inhalte.
Literatur
Nützliche Literatur für die LV ist "Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach" von Compeau und Pevzner, entweder die zweibändige Version from 2015 oder die Version von 2018 in einem Band.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
Module: BIOINF02
Letzte Änderung: Fr 05.02.2021 15:48
b. Inhalte: Die Lehrveranstaltung gibt einen Überblick über die verschiedenen Algorithmen-Klassen und deren Anwendung in der Bioinformatik wie Randomisierte Algorithmen, Graphen-Algorithmen, Brute Force Algorithmen, Dynamische Programmierung, Combinatorische Algorithmen, Evolutionaere Baum-Rekonstruktion, Clustering Algorithmen, Cominatorial Pattern Matching, Hidden Markov Modelle und Methoden der Computational Proteomics.
c. Methoden: Vorlesung, Hausübungen zu den einzelnen Vorlesungsthemen inklusive Programmierung, Hausübungs-Besprechungen mit Lösungpräsentation durch die Studierenden.
HINWEIS: Die Vorlesung und Hausübungs-Besprechungen werden je nach den aktuell geltenden Corona/COVID-19-Bestimmungen in präsenz, hybrid oder rein in distance learning online abgehalten werden.