Universität Wien

053521 VU Sequenz- und Struktur-Bioinformatik (2024S)

6.00 ECTS (4.00 SWS), SPL 5 - Informatik und Wirtschaftsinformatik
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

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Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

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Please ignore the list of dates below. The lecture will be given by the three lecturers on the following dates:

First meeting (Vorbesprechung): Thu Mar 7 13:30-14:30 Online via Moodle

Sequence bioinformatics I (RNA; Ivo Hofacker):
Thu Apr 11, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)
Thu Apr 18, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)
Thu Apr 25, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)
Thu May 2, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)

Structural bioinformatics (Zagrovic):
Mandatory: May 6-8, 9 am – 5 pm
Optional part of the course, separate registration needed: May 9-17, 9 am – 5 pm
HS B in VBC5 (Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Vienna) and CRC01&02 (VBC4/6.505 & 6.506) in the main Max Perutz building (Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Vienna)

Sequence bioinformatics II (Sequence analysis and genomics; Thomas Rattei):
Thu May 23, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7
Thu Jun 6, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7
Thu Jun 13, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7
Thu Jun 20, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7

  • Donnerstag 07.03. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 07.03. 13:30 - 14:30 Digital (Vorbesprechung)
  • Donnerstag 14.03. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 21.03. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 11.04. 13:15 - 16:30 PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 11.04. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 18.04. 13:15 - 16:30 PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 18.04. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 25.04. 13:15 - 16:30 PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 25.04. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 02.05. 13:15 - 16:30 PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 02.05. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 16.05. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 23.05. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 06.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 13.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 20.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Donnerstag 27.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Studierenden sind in der Lage, typische Fragestellungen und Methoden der Sequenz- und Strukturanalyse zu erklären und Experimente mit diesen Methoden zu planen. Die Studierenden können Sequenz- und Strukturdaten mit biologischen Datenbanken vergleichen. Die Studierenden verstehen grundlegende Methoden und Algorithmen der sequenzbasierten Vorhersagen und der Vorhersagen molekularer Strukturen. Sie können diese auf typische Probleme der Biologie und Medizin anwenden und die Resultate interpretieren.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Lösungen von Hausübungen.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Bestandene Angaben der Problemlösungen in Strukturbioinformatik, Sequenz- und Genomanalyse und RNA-Bioinformatik.

Prüfungsstoff

Strukturbioinformatik
Sequenz- und Genomanalyse
RNA-Bioinformatik

Literatur

Wird in der VU bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

Module: BIOINF03

Letzte Änderung: Di 20.02.2024 17:25