053521 VU Sequenz- und Struktur-Bioinformatik (2024S)

6.00 ECTS (4.00 SWS), SPL 5 - Informatik und Wirtschaftsinformatik

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Moodle

Do 02.05. 13:15-16:30 PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Mo 12.02.2024 09:00 bis Do 22.02.2024 09:00
Abmeldung bis Do 14.03.2024 23:59

Details

max. 25 Teilnehmer*innen

Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Please ignore the list of dates below. The lecture will be given by the three lecturers on the following dates:

First meeting (Vorbesprechung): Thu Mar 7 13:30-14:30 Online via Moodle

Sequence bioinformatics I (RNA; Ivo Hofacker):
Thu Apr 11, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)
Thu Apr 18, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)
Thu Apr 25, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)
Thu May 2, 13:15-16:30, PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 (1. OG)

Structural bioinformatics (Zagrovic):
Mandatory: May 6-8, 9 am – 5 pm
Optional part of the course, separate registration needed: May 9-17, 9 am – 5 pm
HS B in VBC5 (Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Vienna) and CRC01&02 (VBC4/6.505 & 6.506) in the main Max Perutz building (Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Vienna)

Sequence bioinformatics II (Sequence analysis and genomics; Thomas Rattei):
Thu May 23, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7
Thu Jun 6, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7
Thu Jun 13, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7
Thu Jun 20, 13:15-16:30 Uhr, UBB Djerassiplatz 1, 1030 Vienna, SR1.7

    
    Donnerstag
    07.03.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    07.03.
    13:30 - 14:30
    Digital
    (Vorbesprechung)
  
    Donnerstag
    14.03.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    21.03.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    11.04.
    13:15 - 16:30
    PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
    
    Donnerstag
    11.04.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    18.04.
    13:15 - 16:30
    PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
    
    Donnerstag
    18.04.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    25.04.
    13:15 - 16:30
    PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
    
    Donnerstag
    25.04.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    N
    Donnerstag
    02.05.
    13:15 - 16:30
    PC-Unterrichtsraum 2, Währinger Straße 29 1.OG
    
    Donnerstag
    02.05.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    16.05.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    23.05.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    06.06.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    13.06.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    20.06.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
    
    Donnerstag
    27.06.
    13:15 - 18:15
    Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Studierenden sind in der Lage, typische Fragestellungen und Methoden der Sequenz- und Strukturanalyse zu erklären und Experimente mit diesen Methoden zu planen. Die Studierenden können Sequenz- und Strukturdaten mit biologischen Datenbanken vergleichen. Die Studierenden verstehen grundlegende Methoden und Algorithmen der sequenzbasierten Vorhersagen und der Vorhersagen molekularer Strukturen. Sie können diese auf typische Probleme der Biologie und Medizin anwenden und die Resultate interpretieren.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Lösungen von Hausübungen.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Bestandene Angaben der Problemlösungen in Strukturbioinformatik, Sequenz- und Genomanalyse und RNA-Bioinformatik.

Prüfungsstoff

Strukturbioinformatik
Sequenz- und Genomanalyse
RNA-Bioinformatik

Literatur

Wird in der VU bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

Module: BIOINF03

Letzte Änderung: Di 20.02.2024 17:25