269020 VO Computational Concepts in Biology II (2020S)
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Details
Sprache: Englisch
Prüfungstermine
Lehrende
- Thomas Rattei
- Andras Aszodi
- Maria Filipa Baltazar de Lima de Sousa
- David Berry
- Christoph Flamm
- Craig Herbold
- Wolfram Weckwerth
- Stefanie Widder
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
11.3. Exact string matching (Thomas Rattei)
18.3. Self learning (No lecture)
25.3. Assembly graphs (Thomas Rattei)
1.4. Self learning (No lecture)
22.4. Self learning (No lecture)
29.4. 13-17 Biological networks I (Stefanie Widder and Christoph Flamm)
6.5. 13-17 Biological networks II (Stefanie Widder and Christoph Flamm)
13.5. Artificial life (Andras Aszodi)
20.5. Microbial Ecology I: PCR and Amplicons (Craig Herbold)
27.5. Microbial Ecology II: Computational concepts (David Berry)
3.6. Comparative Genomics (Filipa Sousa)
10.6. Networks in Biology and Medicine (Jörg Menche)
17.6. Multiomics and System Theory (Wolfram Weckwerth)
24.6. Exam (Rattei)
Mittwoch
11.03.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
18.03.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
25.03.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
01.04.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
22.04.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
29.04.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
06.05.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
13.05.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
20.05.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
27.05.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
03.06.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
10.06.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
17.06.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Mittwoch
24.06.
16:00 - 18:00
Erwin-Schrödinger-Hörsaal, Boltzmanngasse 5, 5. Stk., 1090 Wien
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Written exam
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Ability to explain the biological problem; ability to abstract the biological problem and to connect it to computational concepts; ability to select appropriate mathematical and computational methods; ability to perform selected computational methods and to interprete their results.
Prüfungsstoff
Lectures, seminars, practical exercises, presentations and group discussions.
Literatur
Will be provided during the lecture
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
CO-BIO2
Letzte Änderung: Sa 08.07.2023 00:21
- Large-scale experimental methods
- Data management, reduction, normalization
- Methods for differential analysis and clustering
- Enrichment analysis and network-based analysisBiological networks
- Topological analysis
- Stoichiometric analysis (MFA, FBA)
- Rule-based modeling of combinatorial complex networks
- Differential equation based methods
- Process algebras and model-checkingOrganisms and ecosystems
- Genetics and metabolomics
- Systems biology of human diseases
- Dynamical modeling of organism development (including imaging)
- Environmental modeling (ecoenzymatic theories, stochiometry based theories)
- Information processing in biological systems