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270010 PR Praktikum: Analyse großer Datensätze von "omics"-typ Experimenten (2021W)

3.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Kurs I: 18. 10. 2021 - 25. 10. 2021
Kurs II: 27. 10. 2021 - 02. 11. 2021
Die Anwesenheit am Mo., den 18.10.2021, 10-12h, bei der ersten Einheit des Praktikums (vor Ort im SR3) zu Vorbesprechung, Einteilung, sowie Theorieteil I ist für die Teilnehmer*innen beider Kurse verpflichtend. Generell muss die Anwesenheit während des Praktikums zu 90% erfüllt sein. Theorieteil II für die Teilnehmer*innen beider Kurse findet am Mi., den 20.10.2021, 10h45-12h45h im SR2 statt.

Montag 18.10. 10:00 - 12:00 Seminarraum 3 Organische Chemie 1OG Boltzmanngasse 1
Mittwoch 20.10. 10:45 - 12:45 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Datensätze, die mittels Hochdurchsatzverfahren gewonnen wurden, können aufgrund der großen Datenmenge nicht mehr manuell ausgewertet werden. Die nötige Sorgfalt zur Dateninterpretation muss daher zum Teil an Software-Pakete delegiert werden. Tatsächlich liegen viele Manipulationsschritte zwischen Datenerfassung und Auswertung. Ein Schwerpunkt der Lehrveranstaltung liegt in der Vorstellung der gängigsten Programme zur Unterstützung der Bearbeitung von Daten aus Proteomics, Transcriptomics und Lipidomics. Jeder einzelne Schritt der Datenprozessierung sowie der möglichen Optimierung der Algorithmen und erforderlichen Einstellungen wird analysiert und getestet werden. Ein weiterer Schwerpunkt liegt in dem Einsatz von Programmen zur Interpretation großer Datensätze nach biochemischen bzw. biomedizinischen Kriterien.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Die Leistungskontrolle erfolgt während des Praktikums (Interesse, Mitarbeit), sowie anhand des abgelieferten Protokolls und der erworbenen Kentnisse (beurteilt bei einem Abschlussgespräch).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Jede Teilleistung (Mitarbeit/Interesse, Protokoll & Abschlussgespräch) muss erbracht werden, um die Lehrveranstaltung positiv abschließen zu können.

Prüfungsstoff

Vortrag und praktische Übungen mit realen Datensätzen an Computern

Literatur

Keine zusätzliche Literatur erforderlich.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, BC-1, CHE II-1

Letzte Änderung: Fr 01.10.2021 11:32