270037 UE Übungen zu Computergrafik und Molekulare Modellierung (2015W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Beginn: Dienstag(!) 17.11.2015, 13:30hDie Blocklehrveranstaltung findet am 17.11.-20.11, 24.11-27.11., und (nur bei Bedarf) am 1/2.12. statt.
Zeit: 13:30-17:00h. Ort: Waehringerstr 17, EG, Inst. Computergest. Biol.Chemie.
Zeit: 13:30-17:00h. Ort: Waehringerstr 17, EG, Inst. Computergest. Biol.Chemie.
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Di 15.09.2015 08:00 bis So 04.10.2015 23:59
- Abmeldung bis Do 15.10.2015 23:59
Details
max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lehrende
Termine
Zur Zeit sind keine Termine bekannt.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Beurteilung: Beobachtung der Mitarbeit sowie Beurteilung des abzugebenden Protokolls
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Die Studenten können selbständig Molekülgrafikprogramme verwenden um Informationen über ein bestimmtes Protein zu visualisieren bzw. Unterschiede zwischen verwandten Proteinstrukturen zu
erforschen. Es werden Grundkonzepte von Molekularmechanikrechnungen vermittelt, die zur Ergänzung der strukturbasierten Methoden verwendet
werden.
erforschen. Es werden Grundkonzepte von Molekularmechanikrechnungen vermittelt, die zur Ergänzung der strukturbasierten Methoden verwendet
werden.
Prüfungsstoff
Praktisches Arbeiten am Computer
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
TC-3, M205, M206, CHE II-6, CHE II-7, EF-1, EF-2, EF-3, FEG III-1
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:41
Einführung in die Verwendung von Molekülgrafikprogrammen (WHATIF, vmd). Vergleich von NMR und X-Ray Struktur desselben Biomoleküls.
Quantifizierung von Unterschieden (RMSD, Secondary Structure Assignment, Netzwerk von Wasserstoffbrücken...). Einführung in die weiterführenden Funktionen von WHATIF. Füllen von Lücken in pdb Datensätzen. Aufbau eines Peptids und Zuweisung von Startkoordinaten, z.B. ideale Alphahelix. Modellierung einer Sequenz auf existierende Struktur (z.B. Crambin). "Schöne" Darstellungen (vmd). Kurze Einführung in Molekularmechanikrechnungen (CHARMM).Lernbehelfe: Schriftliche Unterlagen werden zur Verfügung gestellt (zum Grossteil in Englisch!)