Universität Wien

270124 VO Computergrafik und Molekulare Modellierung (2024W)

2.00 ECTS (1.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Moodle
Mi 04.12. 13:00-13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP

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Details

Sprache: Deutsch, Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Immer Mittwoch, HS 3 Chemie, 13:00-13:45
BEGINN: 9.10.2024 (2. Oktoberwoche!)

Je nach Verfuegbarkeit des Hoersaals wuerde ich gerne pro Einheit 60 Minuten (bis 14h) lesen, sodass die VO spaetestens Mitte Jaenner beendet werden kann.

  • Mittwoch 02.10. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 09.10. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 16.10. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 23.10. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 30.10. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 06.11. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 13.11. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 20.11. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 27.11. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 11.12. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 08.01. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 15.01. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 22.01. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 29.01. 13:00 - 13:45 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

1. Computer Graphics (of biomolecules (proteins)), background on protein structure and structure determination, methods of representations, coloring, etc., tools to compare structures, e.g., structural superpositioning.
2. From Geometry to Characterization / Quantification of
Interactions (knowledge based potentials, atomistic force fields, implicit solvation, scoring functions)
3. Using Quantitative Description of Interactions (docking and virtual screening, minimization, normal coordinates, Monte Carlo and molecular dynamics simulations)
4. Special Topics

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Beurteilung: Schriftliche Prüfung (digital)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Positive Abschlusspruefung (50% der maximalen Punktezahl)

Prüfungsstoff

Der folgende Link fuehrt zu Beispielsfragen:

https://docs.google.com/document/d/1HRS5RtRaOkS1_uzyeWrULfKBzT5173KIcFxiHoGScsU

Dieses Dokument wird im Laufe der Vorlesung fuer dieses Semester adaptiert.

Literatur

Pflichtlekture: https://pdb101.rcsb.org/learn/guide-to-understanding-pdb-data/introduction

A. Leach, Molecular Modelling

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

CH-CBS-01, BC-CHE II-7, Design

Letzte Änderung: Do 07.11.2024 10:46