Universität Wien

270127 VU Introduction to metabolic modelling (2022S)

3.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 27 - Chemie
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Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

  • Mittwoch 02.03. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 09.03. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 16.03. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 23.03. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 30.03. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Mittwoch 06.04. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

Inhalte: Mit Computermodellen von biochemischen Netzwerken ist es möglich, bei bekanntem Genotyp Vorhersagen über den Phänotyp zu machen. In dieser Lehrveranstaltung geben wir eine Einführung in die Analyse von metabolischen Netzwerken. Wir behandeln die Rekonstruktion von Netzwerken und stellen constraint-basierte Verfahren vor. Ein Schwerpunkt wird auf (genome-scale) metabolischen Modellen und ihrer Analyse durch Flux-Balance-Analysis und verwandter Methoden liegen. Schließlich stellen wir beispielhafte, erfolgreiche Anwendungen zur Stammoptimierung vor.

(*) Grundlegende mathematische Konzepte in der Systembiologie
(*) Rekonstruktion von (biologischen) Netzwerken
(*) Stöchiometrische Netzwerke und ihre Analyse
(*) Anwendungen in der Biotechnologie

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Verwenden metabolische Modelle zur Stammoptimierung
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Mündliche Prüfung (75%) + kleines Forschungsprojekt (25%) + Hausübung (Bonuspunkte, 4% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Vorwissen in Linearer Algebra ist vorteilhaft und sehr hilfreich aber nicht notwendig.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2

Letzte Änderung: Di 18.10.2022 09:09