270151 VU Computational Systems Biology: from enzymes to networks (2023W)

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

VOR-ORT

Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Mo 04.09.2023 08:00 bis Mo 25.09.2023 23:59
Abmeldung bis Mo 25.09.2023 23:59

Details

max. 20 Teilnehmer*innen

Sprache: Deutsch, Englisch

Lehrende

Diana Szeliova

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

    
    Montag
    16.10.
    16:00 - 18:30
    Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
    
    Dienstag
    17.10.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
    
    Mittwoch
    18.10.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 3 Organische Chemie 1OG Boltzmanngasse 1
    
    Donnerstag
    19.10.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 1 Analytische Chemie 2.OG Boltzmanngasse 1
    
    Freitag
    20.10.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
    
    Montag
    20.11.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
    
    Dienstag
    21.11.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
    
    Mittwoch
    22.11.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
    
    Donnerstag
    23.11.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
    
    Freitag
    24.11.
    16:00 - 18:30
    Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

This course will introduce basic concepts in systems biology and mathematical modelling. It will cover network reconstruction, kinetic modelling and constraint-based analysis of biological networks. In addition, you will get an introduction to COPASI to carry out simple computational analyses of various systems (metabolic networks, epidemiological models, signalling networks, gene expression...).

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Simulationen in Copasi durchführen
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Prüfung (50%) + kleines Forschungsprojekt (35%) + Hausübung (insgesamt 15%, 5% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Grundlegende Kenntnisse der Biologie
Ein gewisses Verständnis für Differentialgleichungen ist hilfreich, aber nicht notwendig

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur

Slides and related scientific publications will be provided during the course

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, BC-1, CHE II-1, BC-3, CH-CBS-05, BC-CHE II-8, Design

Letzte Änderung: Mi 22.11.2023 15:28