Universität Wien

270190 VU Introduction to metabolic modelling (2023S)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Mon., Mar. 27, 6:00 p.m. to 9:00 p.m.; Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP 1H04
Wed., Apr. 19, 4:00 p.m. to 6:00 p.m.; Prominentenzimmer, 1010 Wien, Universitätsring 1, Floor: TP00, Number: TP.274
Tue., Apr. 25, 4:00 p.m. to 6:00 p.m.; Prominentenzimmer, 1010 Wien, Universitätsring 1, Floor: TP00, Number: TP.274
Wed., Apr. 26, 4:00 p.m. to 6:00 p.m.; Prominentenzimmer, 1010 Wien, Universitätsring 1, Floor: TP00, Number: TP.274
Tue., May. 2, 4:00 p.m. to 6:00 p.m.; Prominentenzimmer, 1010 Wien, Universitätsring 1, Floor: TP00, Number: TP.274
Thu., May. 4, 4:00 p.m. to 6:00 p.m.; Prominentenzimmer, 1010 Wien, Universitätsring 1, Floor: TP00, Number: TP.274
Mon., May 15, 6:00 p.m. to 9:00 p.m.; Prominentenzimmer, 1010 Wien, Universitätsring 1, Floor: TP00, Number: TP.274

map of the area:
* Kleiner Hörsaal 3: https://chemie.univie.ac.at/fileadmin/user_upload/f_chemie/hoersaele/2022_HS_und_Seminarraeume_neu.pdf
* Prominentenzimmer: https://www.univie.ac.at/uploads/media/plan-hauptgebaeude-universitaet-wien-2020-v1.pdf

  • Montag 27.03. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Montag 15.05. 18:00 - 21:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

Inhalte: Mit Computermodellen von biochemischen Netzwerken ist es möglich, bei bekanntem Genotyp Vorhersagen über den Phänotyp zu machen. In dieser Lehrveranstaltung geben wir eine Einführung in die Analyse von metabolischen Netzwerken. Wir behandeln die Rekonstruktion von Netzwerken und stellen constraint-basierte Verfahren vor. Ein Schwerpunkt wird auf (genome-scale) metabolischen Modellen und ihrer Analyse durch Flux-Balance-Analysis und verwandter Methoden liegen. Schließlich stellen wir beispielhafte, erfolgreiche Anwendungen zur Stammoptimierung vor.

(*) Grundlegende mathematische Konzepte in der Systembiologie
(*) Rekonstruktion von (biologischen) Netzwerken
(*) Stöchiometrische Netzwerke und ihre Analyse
(*) Anwendungen in der Biotechnologie

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Verwenden metabolische Modelle zur Stammoptimierung
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Mündliche Prüfung (75%) + kleines Forschungsprojekt (25%) + Hausübung (Bonuspunkte, 4% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Vorwissen in Linearer Algebra ist vorteilhaft und sehr hilfreich aber nicht notwendig.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, CH-CBS-05,Design

Letzte Änderung: Di 28.03.2023 13:49