270190 VU Introduction to metabolic modelling (2024S)

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

GEMISCHT

Moodle

Mo 29.04. 16:45-18:15 Prominentenzimmer Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Sa 03.02.2024 08:00 bis Mo 26.02.2024 23:59
Abmeldung bis Mo 26.02.2024 23:59

Details

max. 20 Teilnehmer*innen

Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

    
    Mittwoch
    03.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Mittwoch
    03.04.
    20:15 - 22:00
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Montag
    15.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Montag
    15.04.
    18:30 - 20:00
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Dienstag
    16.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Donnerstag
    18.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Montag
    22.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Dienstag
    23.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    N
    Montag
    29.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Dienstag
    30.04.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Donnerstag
    02.05.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Montag
    13.05.
    16:45 - 18:15
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4
    
    Montag
    13.05.
    18:30 - 20:00
    Prominentenzimmer  Hauptgebäude, Tiefparterre Hof 4

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

Inhalte: Mit Computermodellen von biochemischen Netzwerken ist es möglich, bei bekanntem Genotyp Vorhersagen über den Phänotyp zu machen. In dieser Lehrveranstaltung geben wir eine Einführung in die Analyse von metabolischen Netzwerken. Wir behandeln die Rekonstruktion von Netzwerken und stellen constraint-basierte Verfahren vor. Ein Schwerpunkt wird auf (genome-scale) metabolischen Modellen und ihrer Analyse durch Flux-Balance-Analysis und verwandter Methoden liegen. Schließlich stellen wir beispielhafte, erfolgreiche Anwendungen zur Stammoptimierung vor.

(*) Grundlegende mathematische Konzepte in der Systembiologie
(*) Rekonstruktion von (biologischen) Netzwerken
(*) Stöchiometrische Netzwerke und ihre Analyse
(*) Anwendungen in der Biotechnologie

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Verwenden metabolische Modelle zur Stammoptimierung
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Mündliche Prüfung (75%) + kleines Forschungsprojekt (25%) + Hausübung (Bonuspunkte, 4% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Vorwissen in Linearer Algebra ist vorteilhaft und sehr hilfreich aber nicht notwendig.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, CH-CBS-05,Design

Letzte Änderung: Mo 11.03.2024 13:06