Universität Wien

270199 VO Bioinformatik II (2024S)

Computational Mass Spectrometry

2.00 ECTS (1.00 SWS), SPL 27 - Chemie
VOR-ORT

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Details

Sprache: Deutsch

Lehrende

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Die Lehrveranstaltung beginnt um 09:00 und endet um 10:00. Die LV dauert 60 min.

Donnerstag 07.03. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 14.03. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 21.03. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 11.04. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 18.04. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 25.04. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 16.05. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 23.05. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 06.06. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 13.06. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 20.06. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42
Donnerstag 27.06. 08:00 - 10:00 Hörsaal 4 Chemie HP Währinger Straße 42

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

In diesem Kurs werden die Studierenden in grundlegende Konzepte der Bioinformatik eingeführt, die sich aus den Herausforderungen im Bereich der Massenspektrometrie ergeben, wobei der Schwerpunkt auf Metabolomik, Lipidomik und Proteomik (MLP) liegt. Nach einer Einführung in die Massenspektrometrie selbst wird der Kurs eine Reihe von Mechanismen, Methoden und rechnerischen Notwendigkeiten zusammen mit statistischen Ansätzen zur Datenanalyse und -interpretation vorstellen. Dies beinhaltet Themen wie: Peak Picking, Alignments, APIs, Isotopenkorrektur, Workflow-Systeme, T-Tests mit Korrektur für multiples Testen und statistische Power, oder Datenbankabgleich zur Identifizierung.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Am Ende der Vorlesung müssen die Studierenden eine schriftliche Prüfung ablegen. Um diesen Kurs erfolgreich zu bestehen, müssen die Studierenden mindestens 50% der Punkte in der Prüfung erreichen. Schummlen oder Abschreiben von Mitstudierenden wird nicht toleriert und wird mit 0 Punkten bewertet.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Mindestens 50% der maximal möglichen Punkte müssen erreicht werden, um eine positive Note zu erhalten. Insgesamt können für diesen Kurs 50 Punkte durch eine schriftliche Prüfung am Ende des Kurses erreicht werden.
Die Noten werden nach dem folgenden Schema vergeben:
- 1 (sehr gut): 50 - 45 Punkte
- 2 (gut): 44 - 39 Punkte
- 3 (befriedigend): 38 - 32 Punkte
- 4 (ausreichend): 31 - 25 Punkte
- 5 (ungenügend): 24 - 0 Punkte

Prüfungsstoff

Der in der Vorlesung erlernte Stoff wird zum Abschluss der Veranstaltung in einer 20 minütigen mündlichen Prüfung überprüft.

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

CH-SAS-06

Letzte Änderung: Mo 04.03.2024 10:47