300043 PP Genomanalyse von Prokaryoten (2018S)
Angewandte Bioinformatik zur Analyse eines Genomsequenz
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Fr 09.02.2018 08:00 bis Do 22.02.2018 18:00
- Abmeldung bis Sa 31.03.2018 18:00
Details
max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch
Lehrende
Termine
Blockveranstaltung von 3 Wochen: 2.-18. Juli 2018, jeweils 9-17 Uhr, Seminarraum 2D404, UZA2, Althanstr. 14.
Obligatorischer erster Termin (Vorbesprechung) am Die, 5. Juni 2018, 16-17 Uhr, Übungsraum 6, UZA1, Althanstr. 14, 1090
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Dieses Projektpraktikum vermittelt die Kenntnisse und Fähigkeiten, die für die Sequenzierung, Annotation und Analyse prokaryotischer Genome erforderlich sind. Dies umfasst u.a. Nanopore-Sequenzierung, Assembly, Genvorhersage, Proteinfunktions- und -strukturvorhersage und vergleichende Genomanalysen. Die Sequenzierung und Analyse noch unsequenzierter Genome erlaubt es in diesem Praktikum, aktuelle wissenschaftliche Fragestellungen aus der Mikrobiologie und mikrobiellen Ökologie realitätsnah zu bearbeiten. Grundkenntnisse in der Bioinformatik und Genomik (z.B. wie in der Vorlesung 300311 vermittelt) sind für diese LV erforderlich.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Schriftlicher Bericht im Publikationsformat (kann als Bachelorprojekt genutzt werden).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Sequenzieren mikrobieller DNA; Verstehen und Anwenden wesentlicher Bioinformatik-Methoden der Genomanalyse; Automatisieren umfangreicher Analysen mitteln kleiner selbstgeschriebener Skripte; Interpretation der Ergebnisse umfangreicher Bioinformatik-Analysen im Hinblick auf den zugrunde liegenden Organismus.
Prüfungsstoff
Kenntnisse und Fähigkeiten der Bioinformatik-Methoden zur Genomanalyse.
Umfang und Qualität der praktischen Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen.
Umfang und Qualität der praktischen Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen.
Literatur
Wird im Seminar bereitgestellt.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
B-BOE 13, B-BMB 11B, B-BMG 12B, BOE 13
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:42