300048 UE Sequencing bioinformatics for beginners (2025S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 06.02.2025 14:00 bis Do 20.02.2025 18:00
- Abmeldung bis Sa 15.03.2025 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
- Donnerstag 06.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 13.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 20.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 27.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 03.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 10.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 08.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 15.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 22.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 05.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 12.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- N Donnerstag 26.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Aktive Mitarbeit. Lösen von 4 Aufgaben im Kurs (unter Anleitung).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Einreichen der Lösungsvorschläge für 4 Aufgaben durch Moodle. Bewertet wird zuerst das grundlegende Verständnis der Lösungsansätze, dann die Richtigkeit der Lösung. Jede Aufgabe repräsentiert 25% der Note.
Prüfungsstoff
Application of bash commands introduced in the course; application of mapping, genotyping & filtering tools.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
BAN 5
Letzte Änderung: Mo 24.02.2025 10:47
Wie benutzt man die Command line? Wie arbeitet man mit bash und integrierten Programmen, und nutzt R zu Analyse und Visualisierung? Wie arbeitet man mit großen Dateien, insbesondere durch DNA-Sequenzierung? Welche Dateitypen gibt es in diesem Zusammenhang? Wie benutzt man Referenzgenome, wie werden Sequenzierdaten gemappt und gefiltert? Wie kommt man zu Genotypen, wie prozessiert man diese?