Universität Wien FIND

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300079 SE Bioinformatics meets Proteomics: An Introduction to Computational Proteomics (2018S)

The seminar introduces concepts, algorithms, and software in mass spectrometry-based proteomics

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Details

max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine

Vorbesprechung am 8.3.2018, 14 Uhr im Konferenzraum Ökologie.

Seminartermine:
Donnerstags, wöchentlich, 14-16 Uhr, Konferenzraum Ökologie, UZA1, Ebene2, Spange4, Althanstr. 14


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

The seminar is a brief introduction into mass-spectrometry based proteomics and respective computational concepts, algorithms, and software.

Topics:
- Protein, proteome, and proteomics
- Protein digestion
- Peptide separation
- Mass spectrometry basics
- Mass spectral interpretation
- Protein identification
- Quantitative proteomics
- Protein inference
- Statistical validation

The course will consist of two parts, first a presentation introducing the topic and second a discussion to critically assess the concepts.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Oral exam at the end of semester.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MEV W-1, MES4, MEC-9, MMB W-2, MMB W-3

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43