Universität Wien

300094 UE Proteomics in System Biology (2022S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Preliminary meeting March 1. at 10 am
via Zoom, link will be send.
attendance compulsory!
anticipated dates:
Theory online: Mach 14 and 15.
Lab work will take place March 16-18th.
Datamining: week of march 21th (depending on students, usually 3 days)
Final presentation of students week of March the 28th

Montag 14.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Dienstag 15.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Mittwoch 16.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Donnerstag 17.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Freitag 18.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Montag 21.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Dienstag 22.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Mittwoch 23.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Donnerstag 24.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Freitag 25.03. 09:00 - 19:00 Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Begriffe "Proteomics" und "Metabolomics" haben sich in den letzten Jahren gepraegt und sind inzwischen zu einem festen Bestandteil der modernen Biologie geworden. Analog zum Genom (Gesamtheit aller Erbinformation), Metabolom (Gesamtheit aller Metabolite) stellt das Proteom die Gesamtheit aller aktiven Proteine einer Zelle oder eines Gewebes -also der Proteine/Enzyme aus den verschiedenen Stoffwechselwegen - einer Zelle oder eines Gewebes dar. Die Diversität und Dynamik der Proteine eines Organsimus stellt hohe Anforderungen an bioanalytische Technologien, insbesondere die Massenspektrometrie. Im Rahmen dieses Projektpraktikums sollen Grundbegriffe der Technologie Proteomics vermittelt werden und eine spezielle Technik der massenspektrometrischen Analyse und Datenauswertung ("shotgun proteomics" Identifizierung und Quantifizierung) von Proteinen durchgefuehrt werden. Gleichzeitig werden Grundkenntnisse fuer die Massenspektrometrie in der modernen Biologie vermittelt.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Anwesenheitspflicht, mündlicher Abschlussortrag von Techniken und Ergebnissen(30%) , Praxisraxis und Diskussion (30%), schriiftl. Gruppenprotokoll (40%).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

englisch

Prüfungsstoff

Proteinextraktion, Proteinverdau, Peptidauftrennung HPLC und SDS-PAGE, Massenspektrometrie (Protein identifikation und relative Quantifikation), , Datenanalyse und Interpretation

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BBO 9, BOE 12, MMB W-2, MMEI III, MBO 7, MEC-9, M-WZB, MES5

Letzte Änderung: Mo 23.01.2023 14:09