300094 UE Proteomics in Systems Biology (2023S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Do 09.02.2023 08:00 bis Do 23.02.2023 18:00
Abmeldung bis Mi 15.03.2023 18:00

Details

max. 12 Teilnehmer*innen

Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung 1. März 2023 10 Uhr, via zoom (Link wird am Tag davor versendet). Falls Anwesenheit nicht möglich, muss Prof. Wienkoop benachrichtigt werden und es sollte möglichst ein Ersatz gefunden werden. Bei unendschuldigter nicht Anwesenheit, wird der Platzt an den Nächsten der Warteliste vergeben!
Eine Einfürhungsvorlesung von Prof. Weckwerth wird am 2. März, 11 Uhr via zoom stattfinden (ca 2h).
Der Kurs findet vom 6. bis 17. März statt.

    
    Montag
    06.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Dienstag
    07.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Mittwoch
    08.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Donnerstag
    09.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Freitag
    10.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Dienstag
    14.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Mittwoch
    15.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Donnerstag
    16.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
    
    Freitag
    17.03.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Begriffe "Proteomics" und "Metabolomics" haben sich in den letzten Jahren gepraegt und sind inzwischen zu einem festen Bestandteil der modernen Biologie geworden. Analog zum Genom (Gesamtheit aller Erbinformation), Metabolom (Gesamtheit aller Metabolite) stellt das Proteom die Gesamtheit aller aktiven Proteine einer Zelle oder eines Gewebes -also der Proteine/Enzyme aus den verschiedenen Stoffwechselwegen - einer Zelle oder eines Gewebes dar. Die Diversität und Dynamik der Proteine eines Organsimus stellt hohe Anforderungen an bioanalytische Technologien, insbesondere die Massenspektrometrie. Im Rahmen dieses Projektpraktikums sollen Grundbegriffe der Technologie Proteomics vermittelt werden und eine spezielle Technik der massenspektrometrischen Analyse und Datenauswertung ("shotgun proteomics" Identifizierung und Quantifizierung) von Proteinen durchgefuehrt werden. Gleichzeitig werden Grundkenntnisse fuer die Massenspektrometrie in der modernen Biologie vermittelt.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

mündliche Diskussion, Questionnair (30%), Laborarbeit (20%), schriftl. Gruppenprotokoll (25%), Gruppen-Abschlussvortrag (25%).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

englisch

Prüfungsstoff

Proteinextraktion, Proteinverdau, Peptidauftrennung HPLC und SDS-PAGE, Massenspektrometrie (Protein identifikation und relative Quantifikation), , Datenanalyse und Interpretation

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BBO 9, BOE 12, MMB W-2, MMEI III, MBO 7, MEC-9, M-WZB, MES5

Letzte Änderung: Di 14.03.2023 12:09