Universität Wien FIND

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300118 PP Bioinformatics in Mass Spectrometry (2012W)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Vorbesprechung am 01.10.2012 um 14:00 Uhr im Seminarraum 1320 (Dep.für molekulare Systembiologie)

An/Abmeldung

Details

max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine

Zur Zeit sind keine Termine bekannt.

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Beherrschung der theoretischen und praktischen Grundlagen der Massenspektrometrie.
Einführung in die Proteomanalyse, Metabolomanalyse und Systembiologie.
Einführung in wichtige biologische Datenbanken (Aufbau,Funktion,Formate).
Bioinformatische Proteomanalyse: Datenerfassung,Analyse und Interpretation von Massenspektren. Identifikation von Peptiden in Datenbanken.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Prüfungsimmanente Mitarbeit während des Kurses, schriftliches Protokoll, Seminarvortrag.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Erwerben von Kenntnissen über: Spezielle Methoden der Biostatistik, grundlegende mathematischer und heuristische Algorithmen in der proteomischen Bioinformatik
Erlangen der Qualifikation zur Bearbeitung und Visualisierung bioinformatischer Probleme/ Fragestellungen in der Skriptsprache Python,
Struktur biologischer Datenformate, spezielle Algorithmen in der massenspektrometrischen Analyse Proteom- und Metabolomforschung.
Entwicklung eines eigenen Algorithmus für die Proteinidentifikation.

Prüfungsstoff

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

B-BOE 12, B-BOE 13, BOE 10, BOE 11, BOE 12

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43