Universität Wien

300118 PP Bioinformatics in Mass Spectrometry (2014W)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine

Termine: 10.02.15-14.02.15 und 25.02.15-27.02.15 jeweils von 10:00-18:00 Uhr im Seminarraum 1320 (Dep.für molekulare Systembiologie)

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Beherrschung der theoretischen und praktischen Grundlagen der Massenspektrometrie.
Einführung in die Proteomanalyse, Metabolomanalyse und Systembiologie.
Einführung in wichtige biologische Datenbanken (Aufbau,Funktion,Formate).
Bioinformatische Proteomanalyse: Datenerfassung,Analyse und Interpretation von Massenspektren. Identifikation von Peptiden in Datenbanken.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Prüfungsimmanente Mitarbeit während des Kurses, schriftliches Protokoll, Seminarvortrag.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Erwerben von Kenntnissen über: Spezielle Methoden der Biostatistik, grundlegende mathematischer und heuristische Algorithmen in der proteomischen Bioinformatik
Erlangen der Qualifikation zur Bearbeitung und Visualisierung bioinformatischer Probleme/ Fragestellungen in der Skriptsprache Python,
Struktur biologischer Datenformate, spezielle Algorithmen in der massenspektrometrischen Analyse Proteom- und Metabolomforschung.
Entwicklung eines eigenen Algorithmus für die Proteinidentifikation.

Prüfungsstoff

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

B-BOE 12, B-BOE 13

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43