Universität Wien

300155 UE Introduction to Biological Data Science (2023W)

(Python and R)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine

Vorlesungen: 13:00-15:00 mittwochs, Biologiezentrum Universität Wien,Sitzungssaal im 5. Stock (Deparment of Cognitive Biology),Rm 5.021

Einführung in die Datenwissenschaft mit biologischen, kognitiven und neuronalen Daten

Von den Teilnehmern wird erwartet, dass sie sowohl mit R als auch mit der Programmierung in Python Erfahrung haben.

Wenn Sie keine Python-Erfahrung haben, absolvieren Sie bitte die grundlegenden Tutorials auf learnpython.org VOR Beginn des Kurses.


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Das Ziel dieses Kurses ist es, sowohl theoretische als auch praktische Aspekte der wichtigsten datenwissenschaftlichen Methoden in den Biowissenschaften zu vermitteln. Der Unterricht wird aus einer Kombination von Vorlesungen und Tutorien bestehen.
Der Kurs beginnt mit einer Einführung in die Programmiersprachen R und Python, gefolgt von einigen einführenden Konzepten der Datenanalyse. Als nächstes werden wir uns auf Methoden der Datenvisualisierung konzentrieren, gefolgt von einer Einführung in das maschinelle Lernen.
Im letzten Teil des Kurses werden wir uns mit spezielleren Methoden für die Biologie befassen und uns dabei auf die Analyse von Verhaltens-, neuronalen und evolutionären Daten konzentrieren.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Programmierung von Hausaufgaben, Abschlussprojekt und eine Abschlussprüfung.

Die aktive Teilnahme am Unterricht wird von allen Studenten erwartet.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Aktive Teilnahme am Unterricht und an den Programmierübungen.

(Bewertungskriterien)
1: >87%
2: 76 - 87%
3: 64 - 75%
4: 51 - 63%
5: <=50%

Prüfungsstoff

Fähigkeit, sowohl Python als auch R für grundlegende Datenanalyse- und Visualisierungsaufgaben zu verwenden

Vertrautheit mit den wichtigsten Konzepten der Datenmodellierung und des maschinellen Lernens

vertieftes Verständnis mindestens eines komplexen biologischen Datensatzes (phylogenetische Bäume, Verhaltenszeitreihen, neuronale Daten), nachgewiesen im Abschlussprojekt.

Literatur

Zhang, N. (2020). A tour of data science: learn R and Python in parallel. CRC Press.

Statistical Thinking for the 21st Century:
https://statsthinking21.org/
https://statsthinking21.github.io/statsthinking21-python/index.html
https://statsthinking21.github.io/statsthinking21-figures-R/intro.html

Revell, L. J., & Harmon, L. J. (2022). Phylogenetic comparative methods in R. Princeton University Press.

Géron, A. (2022). Hands-on machine learning with Scikit-Learn, Keras, and TensorFlow. " O'Reilly Media, Inc.".


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

CoBeNe 3

Letzte Änderung: Do 12.10.2023 13:28