Universität Wien

300224 PP Genomanalyse von Prokaryoten (2011S)

Angewandte Bioinformatik zur Analyse eines Genomsequenz

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Vorbesprechung am 1.06.2011 um 15 Uhr im Seminarraum 2.257, UZA I.
Praktikum vom 19.-30.9.2011 je 9-17 Uhr in einem Computerraum UZA2, Althanstr. 14

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch

Lehrende

Termine

Zur Zeit sind keine Termine bekannt.

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Dieses Projektpraktikum vermittelt die Kenntnisse und Fähigkeiten, die für die Annotation und Analyse prokaryotischer Genome erforderlich sind. Dies umfasst u.a. Genvorhersage, Proteinfunktions- und -strukturvorhersage und vergleichende Genomanalysen. Die Analyse aktueller, noch unpublizierter Genomsequenzen mit diesen Bioinformatik-Methoden erlaubt es in diesem Praktikum, aktuelle wissenschaftliche Fragestellungen aus der Mikrobiologie und mikrobiellen Ökologie realitätsnah zu bearbeiten.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftlicher Bericht im Publikationsformat.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verstehen und Anwenden wesentlicher Bioinformatik-Methoden der Genomanalyse; Automatisieren umfangreicher Analysen mitteln kleiner selbstgeschriebener Skripte; Interpretation der Ergebnisse umfangreicher Bioinformatik-Analysen im Hinblick auf den zugrunde liegenden Organismus.

Prüfungsstoff

Diverse Bioinformatik-Methoden zur Genomanalyse, Programmiersprache Perl.
Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen (jede Gruppe bearbeitet ein anderes Genom).

Literatur

Wird bei der Vorbesprechung bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

B-BOE 12, B-BOE 13, B-BMB 11B, B-BMG 12B, BMB 11B, BMG 10B, BOE 10, BOE 11, BOE 12, BMB 11A, BMG 10A

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43