300224 PP Genomanalyse von Prokaryoten (2014S)
Angewandte Bioinformatik zur Analyse eines Genomsequenz
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Vorbesprechung am Dienstag, 3.06.2014 um 15 Uhr im Seminarraum 2.257, UZA I (http://cube.univie.ac.at/contact/). Die Teilnahme an der Vorbesprechung ist für alle TeilnehmerInnen verpflichtend.Praktikum vom 30.6.-11.7.2014 je 9-17 Uhr im Seminarraum 2D404, UZA 2, Althanstr. 14
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Mi 05.02.2014 08:00 bis Do 20.02.2014 18:00
- Abmeldung bis Fr 28.03.2014 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch
Lehrende
Termine
Zur Zeit sind keine Termine bekannt.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Dieses Projektpraktikum vermittelt die Kenntnisse und Fähigkeiten, die für die Annotation und Analyse prokaryotischer Genome erforderlich sind. Dies umfasst u.a. Genvorhersage, Proteinfunktions- und -strukturvorhersage und vergleichende Genomanalysen. Die Analyse aktueller, noch unpublizierter Genomsequenzen mit diesen Bioinformatik-Methoden erlaubt es in diesem Praktikum, aktuelle wissenschaftliche Fragestellungen aus der Mikrobiologie und mikrobiellen Ökologie realitätsnah zu bearbeiten. Grundkenntnisse in der Bioinformatik und Genomik (z.B. wie in der Vorlesung 300311 vermittelt) sind für diese LV erforderlich.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Schriftlicher Bericht im Publikationsformat.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Verstehen und Anwenden wesentlicher Bioinformatik-Methoden der Genomanalyse; Automatisieren umfangreicher Analysen mitteln kleiner selbstgeschriebener Skripte; Interpretation der Ergebnisse umfangreicher Bioinformatik-Analysen im Hinblick auf den zugrunde liegenden Organismus.
Prüfungsstoff
Diverse Bioinformatik-Methoden zur Genomanalyse, Programmiersprache Perl.
Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen (jede Gruppe bearbeitet ein anderes Genom).
Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen (jede Gruppe bearbeitet ein anderes Genom).
Literatur
Wird im Seminar bereitgestellt.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
B-BOE 12, B-BOE 13, B-BMB 11B, B-BMG 12B
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43