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Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

300224 PP Genomanalyse von Prokaryoten (2016S)

Angewandte Bioinformatik zur Analyse eines Genomsequenz

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch

Lehrende

Termine

Blockpraktikum - Termin wird noch vereinbart !


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Dieses Projektpraktikum vermittelt die Kenntnisse und Fähigkeiten, die für die Annotation und Analyse prokaryotischer Genome erforderlich sind. Dies umfasst u.a. Genvorhersage, Proteinfunktions- und -strukturvorhersage und vergleichende Genomanalysen. Die Analyse aktueller, noch unpublizierter Genomsequenzen mit diesen Bioinformatik-Methoden erlaubt es in diesem Praktikum, aktuelle wissenschaftliche Fragestellungen aus der Mikrobiologie und mikrobiellen Ökologie realitätsnah zu bearbeiten. Grundkenntnisse in der Bioinformatik und Genomik (z.B. wie in der Vorlesung 300311 vermittelt) sind für diese LV erforderlich.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftlicher Bericht im Publikationsformat.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verstehen und Anwenden wesentlicher Bioinformatik-Methoden der Genomanalyse; Automatisieren umfangreicher Analysen mitteln kleiner selbstgeschriebener Skripte; Interpretation der Ergebnisse umfangreicher Bioinformatik-Analysen im Hinblick auf den zugrunde liegenden Organismus.

Prüfungsstoff

Diverse Bioinformatik-Methoden zur Genomanalyse, Programmiersprache Perl.
Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen (jede Gruppe bearbeitet ein anderes Genom).

Literatur

Wird im Seminar bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

B-BOE 12, B-BOE 13, B-BMB 11B, B-BMG 12B, BOE 12, BOE 13

Letzte Änderung: Fr 31.08.2018 08:56