Universität Wien FIND

Kehren Sie für das Sommersemester 2022 nach Wien zurück. Wir planen Lehre überwiegend vor Ort, um den persönlichen Austausch zu fördern. Digitale und gemischte Lehrveranstaltungen haben wir für Sie in u:find gekennzeichnet.

Es kann COVID-19-bedingt kurzfristig zu Änderungen kommen (z.B. einzelne Termine digital). Informieren Sie sich laufend in u:find und checken Sie regelmäßig Ihre E-Mails.

Lesen Sie bitte die Informationen auf https://studieren.univie.ac.at/info.

300242 SE Next generation sequencing data analysis (2015W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Date: 25 January 2016 --29 January 2016
Location: EDV room floor 6, Dr. Bohr-Gasse 9, 1030 Wien.

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 16 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch

Lehrende

Termine

Datum: 21.10.-28.10. (5 Tage) ganztags
Ort: PC-Pool Institut f. Theoretische Chemie (2.Stock),
Waehringerstrasse 17, 1090 Wien


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Das Ziel dierser Lehrveranstaltung liegt darin, einfache Analysetechniken im Bereich next gerneration sequencing (NGS) zu vermitteln. Sie richtet sich an Studierende mit wenig bzw keinerlei Vorkenntnissen in der praktischen bioinformatischen Arbeit. Folgende Themen werden behandelt: Einfuerung in die Linux Kommandozeile, Umgang mit den gaengigen NGS Datenformaten und Programmen, wie zB Qualitaetskontrollen, read alignment, differentielle Genexpressions-Analyse sowie Datenaufbereitung und Visualisierung. Diese Themen werden im Rahmen eines kleinen wissenschaftlichen Projektes vermittelt. Nach erfolgreichem Abschluss dieser Lehrveranstaltung sollen Studierende in der Lage sein, einfache NGS Analysen eigenstaendig durchfuehren zu koennen.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Verpflichtende Anwesenheit. Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme, Ergebnis der Analysen und schriftliches Protokoll.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

PhD-MB 2, PhD-MB 7, MMB II-2, MMB W-2, MGE III-1, MGE III-2, MMEI III

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43