300242 SE Next generation sequencing data analysis (2016W)

Das Ziel dierser Lehrveranstaltung liegt darin, einfache Analysetechniken im Bereich next gerneration sequencing (NGS) zu vermitteln. Sie richtet sich an Studierende mit wenig bzw keinerlei Vorkenntnissen in der praktischen bioinformatischen Arbeit. Folgende Themen werden behandelt: Einfuerung in die Linux Kommandozeile, Umgang mit den gaengigen NGS Datenformaten und Programmen, wie zB Qualitaetskontrollen, read alignment, differentielle Genexpressions-Analyse sowie Datenaufbereitung und Visualisierung. Diese Themen werden im Rahmen eines kleinen wissenschaftlichen Projektes vermittelt. Nach erfolgreichem Abschluss dieser Lehrveranstaltung sollen Studierende in der Lage sein, einfache NGS Analysen eigenstaendig durchfuehren zu koennen.