Universität Wien FIND

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300311 VO Bioinformatik für die Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome (2020W)

4.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie

An/Abmeldung

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Details

Sprache: Deutsch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Online Vorlesungen mittwochs 11:30-14:00

Mittwoch 07.10. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 14.10. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 21.10. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 28.10. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 04.11. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 11.11. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 18.11. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 25.11. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 02.12. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 09.12. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 16.12. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 13.01. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 20.01. 11:30 - 14:00 Digital
Mittwoch 27.01. 11:30 - 14:00 Digital

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Diese Vorlesung gibt einen Überblick über Methoden der Bioinformatik zur Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome. Es werden sowohl etablierte Methoden und Werkzeuge, z.B. zur Genvorhersage oder zur funktionellen und strukturellen Klassikation von Proteinen, als auch neu entwickelte Methoden, z.B. zur Funktionszuordnung durch genomische Assoziationen, erläutert und diskutiert. Praktische Übungen demonstrieren den Einsatz ausgewählter Bioinformatik-Programme für typische Problemstellungen.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussklausur im Januar 2020.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verstehen typischer Problemstellungen der mikrobiellen Genomik, Metagenomik und Metatranskriptomik. Anwendung bioinformatischer Methoden zur Lösung dieser Probleme und Interpretation der Ergebnisse im biologischen Kontext.

Beurteilungsmaßstab der schriftlichen Klausur:
<50%: 5
<62.5%: 4
<75%: 3
<87.5%: 2
>=87.5%: 1

Prüfungsstoff

Vortrag und Erörterung/Diskussion von ausgewählten Themen. Unterrichtssprache Deutsch, mit englischsprachigen Materialien. Haus-Übungen.

Literatur

Wird in der Lehrveranstaltung auf der elearning Plattform bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BOE 9, BAN 6, BBO 8, BMG 10, BMB 10, BPB 11, BZO 11, UF BU 10

Letzte Änderung: Di 10.08.2021 16:28