Universität Wien

300311 VO Bioinformatik für die Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome (2024W)

4.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Moodle
Di 22.10. 14:15-16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0

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Details

Sprache: Deutsch

Lehrende

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  • Dienstag 08.10. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 15.10. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 29.10. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 05.11. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 12.11. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 19.11. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 26.11. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 03.12. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 10.12. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 17.12. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 07.01. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 14.01. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 21.01. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Dienstag 28.01. 14:15 - 16:30 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Diese Vorlesung gibt einen Überblick über Methoden der Bioinformatik zur Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome. Es werden sowohl etablierte Methoden und Werkzeuge, z.B. zur Genvorhersage oder zur funktionellen und strukturellen Klassikation von Proteinen, als auch neu entwickelte Methoden, z.B. zur Funktionszuordnung durch genomische Assoziationen, erläutert und diskutiert. Praktische Übungen demonstrieren den Einsatz ausgewählter Bioinformatik-Programme für typische Problemstellungen.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Termine der schriftlichen Abschlussklausuren (open-book: alle schriftlichen/gedruckten Hilfsmittel dürfen verwendet werden):
28.1.2025 14.15-15.45
März 2025, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA
Mai 2025, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA
Juni 2025, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verstehen typischer Problemstellungen der mikrobiellen Genomik, Metagenomik und Metatranskriptomik. Anwendung bioinformatischer Methoden zur Lösung dieser Probleme und Interpretation der Ergebnisse im biologischen Kontext.

Beurteilungsmaßstab der schriftlichen Klausur:
<50%: 5
<62.5%: 4
<75%: 3
<87.5%: 2
>=87.5%: 1

Prüfungsstoff

Vortrag und Erörterung/Diskussion von ausgewählten Themen. Unterrichtssprache Deutsch, mit englischsprachigen Materialien. Haus-Übungen.

Literatur

Wird in der Lehrveranstaltung auf der elearning Plattform bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BOE 9

Letzte Änderung: Mo 07.10.2024 08:06