300312 SE Bioinformatik für Metagenomik und Metatranskriptomik (2010W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Vorbesprechung am 10.1.2011, 16 Uhr im Besprechungsraum Ökologie, UZA I, Raum 2.255
Die LV findet vom 7.-11.2.2011 je 9-17 Uhr im Konferenzraum Ökologie (UZA1 2.241 1.OG) und Computerraum (Bereich Ökologiezentrum) statt !
Die LV findet vom 7.-11.2.2011 je 9-17 Uhr im Konferenzraum Ökologie (UZA1 2.241 1.OG) und Computerraum (Bereich Ökologiezentrum) statt !
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 09.09.2010 09:00 bis Mo 27.09.2010 17:00
- Abmeldung bis Sa 30.10.2010 23:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine
Zur Zeit sind keine Termine bekannt.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
With the breakthrough of next generation DNA sequencing methods and their application to environmental samples, metagenomic and metatranscriptomic sequences have indelibly expanded the known DNA and protein sequence space to non-culturable micro-organisms and environmental communities. This practical seminar introduces the major computational methods necessary to process, analyse and interpret these sequences.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Oral exam or presentation.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Participants learn in this practical seminar how to pre-process environmental sequences (i.e. estimation and correction of sequencing errors), how to estimate taxonomic diversity in metagenomic and metatranscriptomic samples and how to investigate the function and taxonomy of environmental sequences.
Prüfungsstoff
This practical seminar will consist of theoretical (lecture like) introductions to the topics, discussion of selected scientific papers and practical exercises in the computer room.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MOE W-5, MMB W-2, MMB W-3, MMI III-1
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43