300317 VO Biodiversität und molekulare Ökologie der Mikroorganismen 1 (2011W)

Der erste Teil (zweiter Teil findet im Sommersemester statt) befasst sich umfassend mit molekularbiologischen Methoden zur Untersuchung der Zusammensetzung mikrobieller Lebensgemeinschaften in komplexen Umwelt- und medizinischen Proben. Im Anschluss an eine Einführung zum Artkonzept in der Bakteriologie, sowie einer Beschreibung der Parameter mikrobieller Diversität ("species richness" und "species evenness"), wird der vollständige rRNS-Ansatz im Detail behandelt. Weitere molekulare Techniken, die im Rahmen der Lehrveranstaltung anhand ausgewählter Anwendungsbeispiele vorgestellt und kritisch hinsichtlich ihrer Tauglichkeit zur Identifizierung bzw. Quantifizierung von Mikroorganismen diskutiert werden, sind u.a. Fluoreszenz in situ Hybridisierung, quantitative real-time PCR, dot/slot blot und DNA Mikroarray Hybridisierung, DNA Fingerprinting Techniken und neue Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien (454/FLX, Solexa).