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300343 VO Genome structure and evolution (2019W)

2.00 ECTS (1.00 SWS), SPL 30 - Biologie

An/Abmeldung

Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Initial meeting AND FIRST LECTURE: 03.10.2019 11:00
Course will be blocked - every week two hours instead of one hour (last lecture on 14.11.2019).

Donnerstag 03.10. 11:00 - 12:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 10.10. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 17.10. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 24.10. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 31.10. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 07.11. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 14.11. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 28.11. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 05.12. 11:00 - 13:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

This course offers an overview of plant genome structure and evolution. The structure of the nuclear genome (with focus on plant genomes) including types of coding and non-coding DNA sequences that contribute to the genome function and evolution and the mechanisms involved in such change will be discussed in detail. Main chromosomal landmarks (telomeres, centromeres, NORs) will be introduced and discussed in evolutionary context. All these features will be compared with genomic features and evolutionary trends of other organisms (animals, including humans, insects etc.). The newest methods recently developed to analyze genome composition and function including methods to characterize the coding and repetitive DNA fractions (e.g., high-throughput sequencing and high resolution microscopy) will also be introduced. Types and consequences of various genomic changes including polyploidy and more subtle chromosomal rearrangements as well as dynamics of mobile genetic elements in the genome, will be presented and discussed in the comparative phylogenetic context. The course also offers a few hours of practical chromosome handling and light microscopy.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Written exam (100%) from course material; Mindestanforderungen für positive Beurteilung: min. 50% of points

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Knowledge of the structure, types, and function of chromosomes; comparative genome structure and evolution; types and dynamics of repetitive DNAs in the genome; most important cytogenetic and genomic tools and how they contribute to our understanding of genome structure and evolution.

Prüfungsstoff

Lectures (material on moodle), recommended reading (optional)

Literatur

1. Stebbins G.L. 1971. Chromosomal evolution in higher plants. Edward Arnold, London.
2. Fukui K. & Nakamya S. 1996. Plant chromosomes. Laboratory methods. CRC Press, Boca Raton.
3. Maluszynska J. (ed.) 1998. Plant cytogenetics. Silesian University Press, Katowice, Poland.
4. Schwarzacher T. & Heslop-Harrison P. 2000. Practical in situ hybridization. 2nd ed. BIOS, Oxford UK.
5. Levin D.A. 2002. The role of chromosomal change in plant evolution. Oxford University Press, New York, USA.
6. Singh R.J. 2003. Plant cytogenetics. CRC Press, Boca Raton.
7. Puertas M.J. & Naranjo T. (eds.) 2005. Plant cytogenetics. Karger, Basel.
8. Puertas M.J. & Naranjo T. (eds.) 2008. Reviews in plant cytogenetics. Karger, Basel.
9. Birchler J.A. & Pires J.C. (eds.) 2010. Advances in plant cytogenetics. Karger, Basel.
10. Plant Genome Diversity vol. 1 (2012) and 2 (2013). Springer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BBO 2, BAN 6, BMG 10, BMB 10, BOE 11, BPB 11, BZO 11, UF BU 10,

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:22