300362 UE Applied Data Analysis (2022S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 10.02.2022 08:00 bis Do 24.02.2022 18:00
- Abmeldung bis Do 31.03.2022 18:00
Details
max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Donnerstag
17.03.
15:00 - 16:00
Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
(Vorbesprechung)
Montag
25.04.
08:00 - 13:00
Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
Montag
25.04.
13:15 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Mittwoch
27.04.
08:00 - 14:45
Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
Mittwoch
27.04.
15:00 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Freitag
29.04.
08:00 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Montag
02.05.
08:00 - 13:00
Seminarraum 1.4, Biologie Djerassiplatz 1, 1.013, Ebene 1
Montag
02.05.
13:15 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Dienstag
03.05.
08:00 - 13:00
Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Dienstag
03.05.
13:15 - 18:15
Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
Donnerstag
05.05.
08:00 - 18:15
Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Montag
09.05.
08:00 - 13:00
Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Montag
09.05.
13:15 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Dienstag
10.05.
08:00 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Donnerstag
12.05.
08:00 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Freitag
13.05.
08:00 - 18:15
Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
In this course we will learn about modern high-throughput methodologies and get hands-on experience with new methods and real data. We will discuss sequencing technology, experiment design, quality control, assembly, read mapping and counting, differential expression analysis, expression profiles and principal components analysis.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Exercises will be done throughout the course as a part of a collective analysis.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
There are 10 days of the course. Presence on at least 8 days is required. The grade will be based on course participation (20%) and the final report in a form of a scientific paper outlining the aims and analyses completed during the course, as well as potential future directions (80%).
Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.
Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.
Prüfungsstoff
A final report describing the methods used as well as an analysis of the data will be required after completion of the course. Attendance and participation are also graded.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MES6, MMEI III, MGE III-2, MMB W-2, MMB W-3, M-WZB
Letzte Änderung: Mo 23.01.2023 14:09