300369 UE Genomic approaches to variation, adaptation and speciation (2017S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 02.02.2017 08:00 bis Do 16.02.2017 18:00
- Abmeldung bis Fr 31.03.2017 18:00
Details
max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Donnerstag
02.03.
14:00 - 14:30
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag
29.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Dienstag
30.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch
31.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag
01.06.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Freitag
02.06.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Population genomics and genome evolution from next-generation sequencing data, such as whole-genome sequencing, RAD sequencing and transcriptomics. We will exemplify genomic investigation procedures to trace natural selection, genetic ancestry, function, structure and gene-environment interactions, starting with introducing basic omic approaches, such as de novo assembly and mapping.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Active participation in the practical 4 points, two short written exams 5 points each; mini presentation 6 points; thus totalling 20 points.
Credit key: <10 points: 5; 11-12 points: 4; 13-14 points: 3; 15-17 points 2; 18-20 points: 1.
Credit key: <10 points: 5; 11-12 points: 4; 13-14 points: 3; 15-17 points 2; 18-20 points: 1.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
The students are able to understand and apply basic pipelines in genomics (e.g., quality check and filtering of NGS reads; mapping; vcf manipulation; differential expression; SNP calling), and they have good knowledge and skills in the fields of evolutionary and ecological research. Attendance of the complementary lecture VO300127 is highly recommended.
Prüfungsstoff
Practical work at the computer; demonstration
Integration of methods and data in a brief scientific protocol; presentation of a specific aspect pertaining to the content of this course
Integration of methods and data in a brief scientific protocol; presentation of a specific aspect pertaining to the content of this course
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MBO 5, MEV W-1, MEV W-5, MEV W-6, 30.06, MES5
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43